Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc38Q8CDN8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc38Q8CDN8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc38Q8CDN8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc38Q8CDN8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc38Q8CDN8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc38Q8CDN8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc38Q8CDN8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc38Q8CDN8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc38Q8CDN8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc38Q8CDN8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc38Q8CDN8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc38Q8CDN8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc38Q8CDN8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc38Q8CDN8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc38Q8CDN8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc38Q8CDN8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc38Q8CDN8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc38Q8CDN8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc38Q8CDN8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc38Q8CDN8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc38Q8CDN8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc38Q8CDN8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc38Q8CDN8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc38Q8CDN8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc38Q8CDN8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc38Q8CDN8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc38Q8CDN8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc38Q8CDN8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc38Q8CDN8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc38Q8CDN8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc38Q8CDN8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc38Q8CDN8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc38Q8CDN8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc38Q8CDN8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc38Q8CDN8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc38Q8CDN8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc38Q8CDN8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc38Q8CDN8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc38Q8CDN8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc38Q8CDN8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc38Q8CDN8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc38Q8CDN8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc38Q8CDN8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc38Q8CDN8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc38Q8CDN8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc38Q8CDN8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc38Q8CDN8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms