Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBM3

Gm16223, MCG145574 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16223Q8CBM3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Gm16223Q8CBM3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Gm16223Q8CBM3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Gm16223Q8CBM3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm16223Q8CBM3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm16223Q8CBM3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm16223Q8CBM3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm16223Q8CBM3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm16223Q8CBM3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm16223Q8CBM3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm16223Q8CBM3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm16223Q8CBM3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm16223Q8CBM3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm16223Q8CBM3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm16223Q8CBM3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm16223Q8CBM3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm16223Q8CBM3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm16223Q8CBM3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm16223Q8CBM3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm16223Q8CBM3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm16223Q8CBM3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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