Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrn3Q8CBC6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrn3Q8CBC6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrn3Q8CBC6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrn3Q8CBC6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrn3Q8CBC6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrn3Q8CBC6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrn3Q8CBC6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrn3Q8CBC6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrn3Q8CBC6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrn3Q8CBC6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrn3Q8CBC6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrn3Q8CBC6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrn3Q8CBC6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrn3Q8CBC6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrn3Q8CBC6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrn3Q8CBC6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrn3Q8CBC6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrn3Q8CBC6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrn3Q8CBC6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrn3Q8CBC6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrn3Q8CBC6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrn3Q8CBC6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrn3Q8CBC6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrn3Q8CBC6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrn3Q8CBC6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrn3Q8CBC6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrn3Q8CBC6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrn3Q8CBC6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrn3Q8CBC6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrn3Q8CBC6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrn3Q8CBC6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrn3Q8CBC6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrn3Q8CBC6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrn3Q8CBC6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrn3Q8CBC6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrn3Q8CBC6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrn3Q8CBC6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrn3Q8CBC6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrn3Q8CBC6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrn3Q8CBC6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrn3Q8CBC6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrn3Q8CBC6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrn3Q8CBC6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrn3Q8CBC6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrn3Q8CBC6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrn3Q8CBC6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrn3Q8CBC6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrn3Q8CBC6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrn3Q8CBC6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrn3Q8CBC6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrn3Q8CBC6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrn3Q8CBC6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrn3Q8CBC6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrn3Q8CBC6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrn3Q8CBC6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrn3Q8CBC6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrn3Q8CBC6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrn3Q8CBC6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrn3Q8CBC6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrn3Q8CBC6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrn3Q8CBC6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrn3Q8CBC6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrn3Q8CBC6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrn3Q8CBC6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrn3Q8CBC6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lrrn3Q8CBC6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lrrn3Q8CBC6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrn3Q8CBC6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrn3Q8CBC6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrn3Q8CBC6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrn3Q8CBC6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrn3Q8CBC6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrn3Q8CBC6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrn3Q8CBC6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrn3Q8CBC6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrn3Q8CBC6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrn3Q8CBC6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrn3Q8CBC6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrn3Q8CBC6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrn3Q8CBC6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrn3Q8CBC6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrrn3Q8CBC6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrrn3Q8CBC6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrrn3Q8CBC6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrrn3Q8CBC6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrrn3Q8CBC6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrrn3Q8CBC6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrrn3Q8CBC6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrrn3Q8CBC6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrrn3Q8CBC6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrrn3Q8CBC6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrrn3Q8CBC6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrrn3Q8CBC6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrrn3Q8CBC6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrrn3Q8CBC6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrrn3Q8CBC6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrrn3Q8CBC6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrrn3Q8CBC6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrrn3Q8CBC6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
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