Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Atg4aQ8C9S8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atg4aQ8C9S8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Atg4aQ8C9S8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Atg4aQ8C9S8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atg4aQ8C9S8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atg4aQ8C9S8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atg4aQ8C9S8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atg4aQ8C9S8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Atg4aQ8C9S8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atg4aQ8C9S8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atg4aQ8C9S8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atg4aQ8C9S8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atg4aQ8C9S8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atg4aQ8C9S8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Atg4aQ8C9S8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atg4aQ8C9S8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atg4aQ8C9S8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atg4aQ8C9S8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atg4aQ8C9S8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atg4aQ8C9S8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atg4aQ8C9S8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atg4aQ8C9S8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atg4aQ8C9S8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atg4aQ8C9S8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Atg4aQ8C9S8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atg4aQ8C9S8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atg4aQ8C9S8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atg4aQ8C9S8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atg4aQ8C9S8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Atg4aQ8C9S8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atg4aQ8C9S8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atg4aQ8C9S8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atg4aQ8C9S8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atg4aQ8C9S8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atg4aQ8C9S8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atg4aQ8C9S8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atg4aQ8C9S8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atg4aQ8C9S8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atg4aQ8C9S8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atg4aQ8C9S8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atg4aQ8C9S8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atg4aQ8C9S8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atg4aQ8C9S8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atg4aQ8C9S8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Atg4aQ8C9S8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atg4aQ8C9S8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atg4aQ8C9S8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atg4aQ8C9S8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atg4aQ8C9S8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atg4aQ8C9S8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atg4aQ8C9S8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atg4aQ8C9S8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Atg4aQ8C9S8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atg4aQ8C9S8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atg4aQ8C9S8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atg4aQ8C9S8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atg4aQ8C9S8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atg4aQ8C9S8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atg4aQ8C9S8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atg4aQ8C9S8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atg4aQ8C9S8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atg4aQ8C9S8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atg4aQ8C9S8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atg4aQ8C9S8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atg4aQ8C9S8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atg4aQ8C9S8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atg4aQ8C9S8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atg4aQ8C9S8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atg4aQ8C9S8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Atg4aQ8C9S8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atg4aQ8C9S8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atg4aQ8C9S8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atg4aQ8C9S8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atg4aQ8C9S8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atg4aQ8C9S8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atg4aQ8C9S8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atg4aQ8C9S8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atg4aQ8C9S8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atg4aQ8C9S8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atg4aQ8C9S8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atg4aQ8C9S8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atg4aQ8C9S8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atg4aQ8C9S8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atg4aQ8C9S8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atg4aQ8C9S8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atg4aQ8C9S8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atg4aQ8C9S8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atg4aQ8C9S8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atg4aQ8C9S8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Atg4aQ8C9S8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atg4aQ8C9S8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atg4aQ8C9S8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atg4aQ8C9S8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Atg4aQ8C9S8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Atg4aQ8C9S8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Atg4aQ8C9S8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atg4aQ8C9S8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atg4aQ8C9S8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atg4aQ8C9S8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
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