Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bhlhe22Q8C6A8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bhlhe22Q8C6A8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bhlhe22Q8C6A8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bhlhe22Q8C6A8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bhlhe22Q8C6A8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bhlhe22Q8C6A8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bhlhe22Q8C6A8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bhlhe22Q8C6A8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bhlhe22Q8C6A8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bhlhe22Q8C6A8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bhlhe22Q8C6A8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bhlhe22Q8C6A8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bhlhe22Q8C6A8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bhlhe22Q8C6A8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bhlhe22Q8C6A8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bhlhe22Q8C6A8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bhlhe22Q8C6A8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bhlhe22Q8C6A8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Bhlhe22Q8C6A8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Bhlhe22Q8C6A8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bhlhe22Q8C6A8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms