Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5P7

Tdrp, Testis development-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdrpQ8C5P7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TdrpQ8C5P7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TdrpQ8C5P7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TdrpQ8C5P7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TdrpQ8C5P7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TdrpQ8C5P7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TdrpQ8C5P7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TdrpQ8C5P7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TdrpQ8C5P7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TdrpQ8C5P7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TdrpQ8C5P7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TdrpQ8C5P7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TdrpQ8C5P7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TdrpQ8C5P7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TdrpQ8C5P7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TdrpQ8C5P7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TdrpQ8C5P7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TdrpQ8C5P7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TdrpQ8C5P7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TdrpQ8C5P7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TdrpQ8C5P7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TdrpQ8C5P7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TdrpQ8C5P7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TdrpQ8C5P7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TdrpQ8C5P7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TdrpQ8C5P7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TdrpQ8C5P7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TdrpQ8C5P7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TdrpQ8C5P7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TdrpQ8C5P7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TdrpQ8C5P7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TdrpQ8C5P7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TdrpQ8C5P7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TdrpQ8C5P7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TdrpQ8C5P7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TdrpQ8C5P7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TdrpQ8C5P7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TdrpQ8C5P7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TdrpQ8C5P7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TdrpQ8C5P7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TdrpQ8C5P7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TdrpQ8C5P7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TdrpQ8C5P7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TdrpQ8C5P7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TdrpQ8C5P7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TdrpQ8C5P7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TdrpQ8C5P7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TdrpQ8C5P7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TdrpQ8C5P7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TdrpQ8C5P7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TdrpQ8C5P7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TdrpQ8C5P7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TdrpQ8C5P7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TdrpQ8C5P7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TdrpQ8C5P7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TdrpQ8C5P7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TdrpQ8C5P7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TdrpQ8C5P7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TdrpQ8C5P7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TdrpQ8C5P7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TdrpQ8C5P7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TdrpQ8C5P7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TdrpQ8C5P7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TdrpQ8C5P7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TdrpQ8C5P7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TdrpQ8C5P7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TdrpQ8C5P7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TdrpQ8C5P7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TdrpQ8C5P7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TdrpQ8C5P7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TdrpQ8C5P7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TdrpQ8C5P7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TdrpQ8C5P7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TdrpQ8C5P7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TdrpQ8C5P7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TdrpQ8C5P7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TdrpQ8C5P7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TdrpQ8C5P7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TdrpQ8C5P7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TdrpQ8C5P7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TdrpQ8C5P7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TdrpQ8C5P7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TdrpQ8C5P7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TdrpQ8C5P7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TdrpQ8C5P7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TdrpQ8C5P7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TdrpQ8C5P7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TdrpQ8C5P7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TdrpQ8C5P7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TdrpQ8C5P7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TdrpQ8C5P7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TdrpQ8C5P7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TdrpQ8C5P7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TdrpQ8C5P7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TdrpQ8C5P7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TdrpQ8C5P7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TdrpQ8C5P7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TdrpQ8C5P7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TdrpQ8C5P7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TdrpQ8C5P7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms