Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4J0

Ccdc60, Coiled-coil domain-containing protein 60, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc60Q8C4J0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc60Q8C4J0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc60Q8C4J0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc60Q8C4J0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc60Q8C4J0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc60Q8C4J0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc60Q8C4J0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc60Q8C4J0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc60Q8C4J0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc60Q8C4J0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc60Q8C4J0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc60Q8C4J0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc60Q8C4J0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc60Q8C4J0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc60Q8C4J0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc60Q8C4J0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc60Q8C4J0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc60Q8C4J0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc60Q8C4J0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc60Q8C4J0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc60Q8C4J0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc60Q8C4J0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc60Q8C4J0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc60Q8C4J0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc60Q8C4J0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc60Q8C4J0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc60Q8C4J0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc60Q8C4J0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc60Q8C4J0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc60Q8C4J0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc60Q8C4J0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc60Q8C4J0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc60Q8C4J0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc60Q8C4J0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc60Q8C4J0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc60Q8C4J0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc60Q8C4J0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc60Q8C4J0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc60Q8C4J0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc60Q8C4J0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc60Q8C4J0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc60Q8C4J0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc60Q8C4J0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc60Q8C4J0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc60Q8C4J0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc60Q8C4J0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc60Q8C4J0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc60Q8C4J0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc60Q8C4J0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc60Q8C4J0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc60Q8C4J0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc60Q8C4J0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc60Q8C4J0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc60Q8C4J0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc60Q8C4J0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc60Q8C4J0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc60Q8C4J0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc60Q8C4J0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc60Q8C4J0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc60Q8C4J0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc60Q8C4J0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc60Q8C4J0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc60Q8C4J0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc60Q8C4J0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc60Q8C4J0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc60Q8C4J0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc60Q8C4J0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc60Q8C4J0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc60Q8C4J0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc60Q8C4J0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc60Q8C4J0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc60Q8C4J0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc60Q8C4J0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc60Q8C4J0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc60Q8C4J0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc60Q8C4J0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc60Q8C4J0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc60Q8C4J0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc60Q8C4J0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc60Q8C4J0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc60Q8C4J0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc60Q8C4J0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc60Q8C4J0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc60Q8C4J0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc60Q8C4J0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc60Q8C4J0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc60Q8C4J0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc60Q8C4J0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc60Q8C4J0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc60Q8C4J0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc60Q8C4J0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc60Q8C4J0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc60Q8C4J0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc60Q8C4J0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc60Q8C4J0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc60Q8C4J0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc60Q8C4J0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc60Q8C4J0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc60Q8C4J0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc60Q8C4J0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms