Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Amigo3Q8C2S7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Amigo3Q8C2S7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Amigo3Q8C2S7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Amigo3Q8C2S7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Amigo3Q8C2S7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Amigo3Q8C2S7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Amigo3Q8C2S7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Amigo3Q8C2S7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Amigo3Q8C2S7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
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