Protein–RNA interactions for Protein: Q8C156

Ncaph, Condensin complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcaphQ8C156 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NcaphQ8C156 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NcaphQ8C156 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NcaphQ8C156 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NcaphQ8C156 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NcaphQ8C156 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NcaphQ8C156 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NcaphQ8C156 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NcaphQ8C156 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NcaphQ8C156 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NcaphQ8C156 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NcaphQ8C156 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NcaphQ8C156 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NcaphQ8C156 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NcaphQ8C156 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NcaphQ8C156 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NcaphQ8C156 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NcaphQ8C156 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NcaphQ8C156 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NcaphQ8C156 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NcaphQ8C156 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NcaphQ8C156 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NcaphQ8C156 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NcaphQ8C156 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NcaphQ8C156 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NcaphQ8C156 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NcaphQ8C156 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NcaphQ8C156 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NcaphQ8C156 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NcaphQ8C156 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NcaphQ8C156 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NcaphQ8C156 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NcaphQ8C156 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NcaphQ8C156 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NcaphQ8C156 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NcaphQ8C156 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NcaphQ8C156 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NcaphQ8C156 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NcaphQ8C156 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NcaphQ8C156 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NcaphQ8C156 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NcaphQ8C156 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NcaphQ8C156 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NcaphQ8C156 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NcaphQ8C156 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NcaphQ8C156 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NcaphQ8C156 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NcaphQ8C156 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NcaphQ8C156 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NcaphQ8C156 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NcaphQ8C156 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NcaphQ8C156 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NcaphQ8C156 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NcaphQ8C156 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NcaphQ8C156 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NcaphQ8C156 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NcaphQ8C156 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NcaphQ8C156 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NcaphQ8C156 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NcaphQ8C156 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NcaphQ8C156 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NcaphQ8C156 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NcaphQ8C156 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NcaphQ8C156 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NcaphQ8C156 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NcaphQ8C156 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NcaphQ8C156 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NcaphQ8C156 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NcaphQ8C156 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NcaphQ8C156 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NcaphQ8C156 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NcaphQ8C156 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NcaphQ8C156 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NcaphQ8C156 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NcaphQ8C156 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NcaphQ8C156 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NcaphQ8C156 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NcaphQ8C156 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NcaphQ8C156 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NcaphQ8C156 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NcaphQ8C156 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NcaphQ8C156 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NcaphQ8C156 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NcaphQ8C156 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NcaphQ8C156 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NcaphQ8C156 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NcaphQ8C156 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NcaphQ8C156 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NcaphQ8C156 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NcaphQ8C156 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NcaphQ8C156 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NcaphQ8C156 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NcaphQ8C156 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NcaphQ8C156 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NcaphQ8C156 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NcaphQ8C156 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NcaphQ8C156 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NcaphQ8C156 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NcaphQ8C156 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NcaphQ8C156 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms