Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0L9

Gpcpd1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpcpd1Q8C0L9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gpcpd1Q8C0L9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gpcpd1Q8C0L9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gpcpd1Q8C0L9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gpcpd1Q8C0L9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gpcpd1Q8C0L9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gpcpd1Q8C0L9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gpcpd1Q8C0L9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Gpcpd1Q8C0L9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gpcpd1Q8C0L9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gpcpd1Q8C0L9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gpcpd1Q8C0L9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gpcpd1Q8C0L9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gpcpd1Q8C0L9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gpcpd1Q8C0L9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gpcpd1Q8C0L9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gpcpd1Q8C0L9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gpcpd1Q8C0L9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gpcpd1Q8C0L9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gpcpd1Q8C0L9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gpcpd1Q8C0L9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gpcpd1Q8C0L9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gpcpd1Q8C0L9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gpcpd1Q8C0L9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gpcpd1Q8C0L9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gpcpd1Q8C0L9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gpcpd1Q8C0L9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gpcpd1Q8C0L9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gpcpd1Q8C0L9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gpcpd1Q8C0L9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gpcpd1Q8C0L9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gpcpd1Q8C0L9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gpcpd1Q8C0L9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gpcpd1Q8C0L9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gpcpd1Q8C0L9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gpcpd1Q8C0L9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gpcpd1Q8C0L9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gpcpd1Q8C0L9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gpcpd1Q8C0L9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gpcpd1Q8C0L9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Gpcpd1Q8C0L9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gpcpd1Q8C0L9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gpcpd1Q8C0L9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gpcpd1Q8C0L9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gpcpd1Q8C0L9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gpcpd1Q8C0L9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gpcpd1Q8C0L9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gpcpd1Q8C0L9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gpcpd1Q8C0L9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gpcpd1Q8C0L9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gpcpd1Q8C0L9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gpcpd1Q8C0L9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gpcpd1Q8C0L9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gpcpd1Q8C0L9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gpcpd1Q8C0L9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gpcpd1Q8C0L9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gpcpd1Q8C0L9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gpcpd1Q8C0L9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gpcpd1Q8C0L9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gpcpd1Q8C0L9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gpcpd1Q8C0L9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gpcpd1Q8C0L9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gpcpd1Q8C0L9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gpcpd1Q8C0L9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gpcpd1Q8C0L9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gpcpd1Q8C0L9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gpcpd1Q8C0L9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gpcpd1Q8C0L9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gpcpd1Q8C0L9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gpcpd1Q8C0L9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gpcpd1Q8C0L9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gpcpd1Q8C0L9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gpcpd1Q8C0L9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gpcpd1Q8C0L9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gpcpd1Q8C0L9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gpcpd1Q8C0L9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gpcpd1Q8C0L9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gpcpd1Q8C0L9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Gpcpd1Q8C0L9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gpcpd1Q8C0L9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gpcpd1Q8C0L9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gpcpd1Q8C0L9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gpcpd1Q8C0L9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Gpcpd1Q8C0L9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gpcpd1Q8C0L9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gpcpd1Q8C0L9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gpcpd1Q8C0L9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gpcpd1Q8C0L9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gpcpd1Q8C0L9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gpcpd1Q8C0L9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Gpcpd1Q8C0L9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gpcpd1Q8C0L9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gpcpd1Q8C0L9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gpcpd1Q8C0L9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gpcpd1Q8C0L9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gpcpd1Q8C0L9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gpcpd1Q8C0L9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gpcpd1Q8C0L9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Gpcpd1Q8C0L9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gpcpd1Q8C0L9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms