Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccser1Q8C0C4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccser1Q8C0C4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccser1Q8C0C4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccser1Q8C0C4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccser1Q8C0C4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccser1Q8C0C4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccser1Q8C0C4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccser1Q8C0C4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccser1Q8C0C4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccser1Q8C0C4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccser1Q8C0C4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccser1Q8C0C4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccser1Q8C0C4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccser1Q8C0C4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccser1Q8C0C4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccser1Q8C0C4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccser1Q8C0C4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccser1Q8C0C4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccser1Q8C0C4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccser1Q8C0C4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccser1Q8C0C4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccser1Q8C0C4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccser1Q8C0C4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccser1Q8C0C4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccser1Q8C0C4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccser1Q8C0C4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccser1Q8C0C4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccser1Q8C0C4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccser1Q8C0C4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccser1Q8C0C4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccser1Q8C0C4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccser1Q8C0C4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccser1Q8C0C4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccser1Q8C0C4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccser1Q8C0C4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccser1Q8C0C4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccser1Q8C0C4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccser1Q8C0C4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccser1Q8C0C4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccser1Q8C0C4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccser1Q8C0C4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccser1Q8C0C4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccser1Q8C0C4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccser1Q8C0C4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccser1Q8C0C4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccser1Q8C0C4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccser1Q8C0C4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccser1Q8C0C4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccser1Q8C0C4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccser1Q8C0C4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccser1Q8C0C4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccser1Q8C0C4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccser1Q8C0C4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccser1Q8C0C4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccser1Q8C0C4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccser1Q8C0C4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccser1Q8C0C4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccser1Q8C0C4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccser1Q8C0C4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccser1Q8C0C4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccser1Q8C0C4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccser1Q8C0C4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccser1Q8C0C4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccser1Q8C0C4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccser1Q8C0C4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccser1Q8C0C4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccser1Q8C0C4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccser1Q8C0C4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccser1Q8C0C4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccser1Q8C0C4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccser1Q8C0C4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccser1Q8C0C4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccser1Q8C0C4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccser1Q8C0C4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccser1Q8C0C4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccser1Q8C0C4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccser1Q8C0C4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccser1Q8C0C4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccser1Q8C0C4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccser1Q8C0C4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccser1Q8C0C4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccser1Q8C0C4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccser1Q8C0C4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccser1Q8C0C4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccser1Q8C0C4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccser1Q8C0C4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccser1Q8C0C4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccser1Q8C0C4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccser1Q8C0C4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccser1Q8C0C4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccser1Q8C0C4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccser1Q8C0C4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccser1Q8C0C4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccser1Q8C0C4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccser1Q8C0C4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccser1Q8C0C4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccser1Q8C0C4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccser1Q8C0C4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccser1Q8C0C4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms