Protein–RNA interactions for Protein: Q8C084

Snx22, Sorting nexin 22, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx22Q8C084 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx22Q8C084 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx22Q8C084 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx22Q8C084 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx22Q8C084 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx22Q8C084 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx22Q8C084 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx22Q8C084 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx22Q8C084 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx22Q8C084 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx22Q8C084 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx22Q8C084 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx22Q8C084 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx22Q8C084 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx22Q8C084 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx22Q8C084 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx22Q8C084 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx22Q8C084 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx22Q8C084 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx22Q8C084 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx22Q8C084 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx22Q8C084 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx22Q8C084 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx22Q8C084 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx22Q8C084 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx22Q8C084 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx22Q8C084 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx22Q8C084 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx22Q8C084 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx22Q8C084 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx22Q8C084 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx22Q8C084 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx22Q8C084 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx22Q8C084 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx22Q8C084 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx22Q8C084 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx22Q8C084 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx22Q8C084 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx22Q8C084 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx22Q8C084 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx22Q8C084 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms