Protein–RNA interactions for Protein: Q8C050

Rps6ka5, Ribosomal protein S6 kinase alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka5Q8C050 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rps6ka5Q8C050 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rps6ka5Q8C050 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rps6ka5Q8C050 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rps6ka5Q8C050 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rps6ka5Q8C050 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rps6ka5Q8C050 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rps6ka5Q8C050 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rps6ka5Q8C050 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rps6ka5Q8C050 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rps6ka5Q8C050 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rps6ka5Q8C050 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rps6ka5Q8C050 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rps6ka5Q8C050 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rps6ka5Q8C050 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rps6ka5Q8C050 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rps6ka5Q8C050 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rps6ka5Q8C050 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rps6ka5Q8C050 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rps6ka5Q8C050 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rps6ka5Q8C050 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rps6ka5Q8C050 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rps6ka5Q8C050 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rps6ka5Q8C050 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rps6ka5Q8C050 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rps6ka5Q8C050 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rps6ka5Q8C050 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rps6ka5Q8C050 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rps6ka5Q8C050 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rps6ka5Q8C050 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rps6ka5Q8C050 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rps6ka5Q8C050 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rps6ka5Q8C050 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rps6ka5Q8C050 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rps6ka5Q8C050 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rps6ka5Q8C050 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rps6ka5Q8C050 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rps6ka5Q8C050 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rps6ka5Q8C050 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rps6ka5Q8C050 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rps6ka5Q8C050 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rps6ka5Q8C050 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rps6ka5Q8C050 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rps6ka5Q8C050 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rps6ka5Q8C050 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rps6ka5Q8C050 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rps6ka5Q8C050 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rps6ka5Q8C050 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rps6ka5Q8C050 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rps6ka5Q8C050 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rps6ka5Q8C050 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rps6ka5Q8C050 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps6ka5Q8C050 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps6ka5Q8C050 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps6ka5Q8C050 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps6ka5Q8C050 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps6ka5Q8C050 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps6ka5Q8C050 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps6ka5Q8C050 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps6ka5Q8C050 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps6ka5Q8C050 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rps6ka5Q8C050 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rps6ka5Q8C050 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rps6ka5Q8C050 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rps6ka5Q8C050 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rps6ka5Q8C050 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rps6ka5Q8C050 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rps6ka5Q8C050 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rps6ka5Q8C050 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rps6ka5Q8C050 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rps6ka5Q8C050 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rps6ka5Q8C050 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rps6ka5Q8C050 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rps6ka5Q8C050 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rps6ka5Q8C050 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rps6ka5Q8C050 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rps6ka5Q8C050 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rps6ka5Q8C050 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rps6ka5Q8C050 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rps6ka5Q8C050 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rps6ka5Q8C050 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rps6ka5Q8C050 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rps6ka5Q8C050 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rps6ka5Q8C050 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rps6ka5Q8C050 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rps6ka5Q8C050 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rps6ka5Q8C050 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rps6ka5Q8C050 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rps6ka5Q8C050 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rps6ka5Q8C050 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rps6ka5Q8C050 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rps6ka5Q8C050 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rps6ka5Q8C050 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rps6ka5Q8C050 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps6ka5Q8C050 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps6ka5Q8C050 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps6ka5Q8C050 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps6ka5Q8C050 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps6ka5Q8C050 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps6ka5Q8C050 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms