Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYI9

Tnr, Tenascin-R, mousemouse

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnrQ8BYI9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TnrQ8BYI9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TnrQ8BYI9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TnrQ8BYI9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TnrQ8BYI9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TnrQ8BYI9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TnrQ8BYI9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TnrQ8BYI9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TnrQ8BYI9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TnrQ8BYI9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TnrQ8BYI9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TnrQ8BYI9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TnrQ8BYI9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TnrQ8BYI9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TnrQ8BYI9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TnrQ8BYI9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TnrQ8BYI9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TnrQ8BYI9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TnrQ8BYI9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TnrQ8BYI9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TnrQ8BYI9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TnrQ8BYI9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TnrQ8BYI9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TnrQ8BYI9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TnrQ8BYI9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TnrQ8BYI9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TnrQ8BYI9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TnrQ8BYI9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TnrQ8BYI9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TnrQ8BYI9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TnrQ8BYI9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TnrQ8BYI9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TnrQ8BYI9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TnrQ8BYI9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TnrQ8BYI9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TnrQ8BYI9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TnrQ8BYI9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TnrQ8BYI9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TnrQ8BYI9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TnrQ8BYI9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TnrQ8BYI9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TnrQ8BYI9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TnrQ8BYI9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TnrQ8BYI9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TnrQ8BYI9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TnrQ8BYI9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TnrQ8BYI9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TnrQ8BYI9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TnrQ8BYI9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TnrQ8BYI9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TnrQ8BYI9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TnrQ8BYI9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TnrQ8BYI9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TnrQ8BYI9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TnrQ8BYI9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TnrQ8BYI9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TnrQ8BYI9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TnrQ8BYI9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TnrQ8BYI9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TnrQ8BYI9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TnrQ8BYI9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TnrQ8BYI9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TnrQ8BYI9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TnrQ8BYI9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TnrQ8BYI9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TnrQ8BYI9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TnrQ8BYI9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TnrQ8BYI9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
TnrQ8BYI9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TnrQ8BYI9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TnrQ8BYI9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TnrQ8BYI9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TnrQ8BYI9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TnrQ8BYI9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TnrQ8BYI9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TnrQ8BYI9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TnrQ8BYI9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TnrQ8BYI9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TnrQ8BYI9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TnrQ8BYI9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TnrQ8BYI9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TnrQ8BYI9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TnrQ8BYI9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
TnrQ8BYI9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TnrQ8BYI9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TnrQ8BYI9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TnrQ8BYI9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TnrQ8BYI9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TnrQ8BYI9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TnrQ8BYI9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TnrQ8BYI9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TnrQ8BYI9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TnrQ8BYI9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TnrQ8BYI9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TnrQ8BYI9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TnrQ8BYI9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TnrQ8BYI9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TnrQ8BYI9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TnrQ8BYI9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TnrQ8BYI9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms