Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXN9

Tmem87a, Transmembrane protein 87A, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem87aQ8BXN9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmem87aQ8BXN9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem87aQ8BXN9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem87aQ8BXN9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem87aQ8BXN9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem87aQ8BXN9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem87aQ8BXN9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem87aQ8BXN9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem87aQ8BXN9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem87aQ8BXN9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem87aQ8BXN9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem87aQ8BXN9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem87aQ8BXN9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem87aQ8BXN9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem87aQ8BXN9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem87aQ8BXN9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem87aQ8BXN9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem87aQ8BXN9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem87aQ8BXN9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem87aQ8BXN9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem87aQ8BXN9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem87aQ8BXN9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem87aQ8BXN9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem87aQ8BXN9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem87aQ8BXN9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem87aQ8BXN9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem87aQ8BXN9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem87aQ8BXN9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem87aQ8BXN9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem87aQ8BXN9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem87aQ8BXN9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem87aQ8BXN9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem87aQ8BXN9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem87aQ8BXN9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem87aQ8BXN9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem87aQ8BXN9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem87aQ8BXN9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem87aQ8BXN9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem87aQ8BXN9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem87aQ8BXN9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem87aQ8BXN9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem87aQ8BXN9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem87aQ8BXN9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem87aQ8BXN9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tmem87aQ8BXN9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms