Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctdsp2Q8BX07 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctdsp2Q8BX07 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctdsp2Q8BX07 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctdsp2Q8BX07 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctdsp2Q8BX07 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctdsp2Q8BX07 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctdsp2Q8BX07 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctdsp2Q8BX07 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctdsp2Q8BX07 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctdsp2Q8BX07 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctdsp2Q8BX07 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctdsp2Q8BX07 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctdsp2Q8BX07 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctdsp2Q8BX07 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctdsp2Q8BX07 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctdsp2Q8BX07 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctdsp2Q8BX07 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctdsp2Q8BX07 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctdsp2Q8BX07 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctdsp2Q8BX07 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctdsp2Q8BX07 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctdsp2Q8BX07 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctdsp2Q8BX07 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctdsp2Q8BX07 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctdsp2Q8BX07 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctdsp2Q8BX07 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctdsp2Q8BX07 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctdsp2Q8BX07 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctdsp2Q8BX07 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctdsp2Q8BX07 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctdsp2Q8BX07 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctdsp2Q8BX07 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctdsp2Q8BX07 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctdsp2Q8BX07 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctdsp2Q8BX07 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctdsp2Q8BX07 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctdsp2Q8BX07 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctdsp2Q8BX07 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctdsp2Q8BX07 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctdsp2Q8BX07 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctdsp2Q8BX07 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctdsp2Q8BX07 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctdsp2Q8BX07 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms