Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW49

Ttc12, Tetratricopeptide repeat protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc12Q8BW49 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ttc12Q8BW49 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ttc12Q8BW49 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttc12Q8BW49 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttc12Q8BW49 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttc12Q8BW49 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttc12Q8BW49 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttc12Q8BW49 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttc12Q8BW49 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttc12Q8BW49 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttc12Q8BW49 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttc12Q8BW49 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ttc12Q8BW49 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ttc12Q8BW49 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ttc12Q8BW49 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ttc12Q8BW49 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ttc12Q8BW49 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc12Q8BW49 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc12Q8BW49 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc12Q8BW49 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc12Q8BW49 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc12Q8BW49 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc12Q8BW49 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc12Q8BW49 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc12Q8BW49 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc12Q8BW49 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc12Q8BW49 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc12Q8BW49 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ttc12Q8BW49 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ttc12Q8BW49 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ttc12Q8BW49 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ttc12Q8BW49 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ttc12Q8BW49 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ttc12Q8BW49 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ttc12Q8BW49 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ttc12Q8BW49 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ttc12Q8BW49 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ttc12Q8BW49 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ttc12Q8BW49 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ttc12Q8BW49 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ttc12Q8BW49 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ttc12Q8BW49 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ttc12Q8BW49 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ttc12Q8BW49 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ttc12Q8BW49 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ttc12Q8BW49 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ttc12Q8BW49 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ttc12Q8BW49 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ttc12Q8BW49 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ttc12Q8BW49 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ttc12Q8BW49 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ttc12Q8BW49 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ttc12Q8BW49 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ttc12Q8BW49 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ttc12Q8BW49 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ttc12Q8BW49 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ttc12Q8BW49 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ttc12Q8BW49 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ttc12Q8BW49 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ttc12Q8BW49 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ttc12Q8BW49 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ttc12Q8BW49 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ttc12Q8BW49 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ttc12Q8BW49 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ttc12Q8BW49 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ttc12Q8BW49 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ttc12Q8BW49 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ttc12Q8BW49 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ttc12Q8BW49 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ttc12Q8BW49 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ttc12Q8BW49 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ttc12Q8BW49 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ttc12Q8BW49 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ttc12Q8BW49 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ttc12Q8BW49 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ttc12Q8BW49 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ttc12Q8BW49 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ttc12Q8BW49 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ttc12Q8BW49 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ttc12Q8BW49 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ttc12Q8BW49 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ttc12Q8BW49 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ttc12Q8BW49 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ttc12Q8BW49 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ttc12Q8BW49 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ttc12Q8BW49 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ttc12Q8BW49 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ttc12Q8BW49 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ttc12Q8BW49 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ttc12Q8BW49 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ttc12Q8BW49 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ttc12Q8BW49 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ttc12Q8BW49 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ttc12Q8BW49 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ttc12Q8BW49 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ttc12Q8BW49 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ttc12Q8BW49 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ttc12Q8BW49 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ttc12Q8BW49 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ttc12Q8BW49 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms