Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV84

Prr9, Proline-rich protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr9Q8BV84 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prr9Q8BV84 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prr9Q8BV84 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prr9Q8BV84 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prr9Q8BV84 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prr9Q8BV84 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prr9Q8BV84 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prr9Q8BV84 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prr9Q8BV84 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prr9Q8BV84 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prr9Q8BV84 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prr9Q8BV84 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prr9Q8BV84 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prr9Q8BV84 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prr9Q8BV84 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prr9Q8BV84 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prr9Q8BV84 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prr9Q8BV84 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prr9Q8BV84 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prr9Q8BV84 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr9Q8BV84 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr9Q8BV84 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr9Q8BV84 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr9Q8BV84 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr9Q8BV84 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr9Q8BV84 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr9Q8BV84 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr9Q8BV84 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prr9Q8BV84 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr9Q8BV84 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr9Q8BV84 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr9Q8BV84 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr9Q8BV84 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr9Q8BV84 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr9Q8BV84 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr9Q8BV84 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr9Q8BV84 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prr9Q8BV84 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr9Q8BV84 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr9Q8BV84 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr9Q8BV84 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr9Q8BV84 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms