Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cep55Q8BT07 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cep55Q8BT07 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cep55Q8BT07 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cep55Q8BT07 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cep55Q8BT07 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cep55Q8BT07 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cep55Q8BT07 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cep55Q8BT07 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Cep55Q8BT07 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cep55Q8BT07 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cep55Q8BT07 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cep55Q8BT07 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cep55Q8BT07 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cep55Q8BT07 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cep55Q8BT07 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cep55Q8BT07 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cep55Q8BT07 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cep55Q8BT07 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Cep55Q8BT07 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cep55Q8BT07 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cep55Q8BT07 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cep55Q8BT07 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cep55Q8BT07 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cep55Q8BT07 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cep55Q8BT07 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cep55Q8BT07 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cep55Q8BT07 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cep55Q8BT07 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cep55Q8BT07 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cep55Q8BT07 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cep55Q8BT07 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cep55Q8BT07 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cep55Q8BT07 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cep55Q8BT07 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cep55Q8BT07 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cep55Q8BT07 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cep55Q8BT07 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cep55Q8BT07 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cep55Q8BT07 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cep55Q8BT07 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cep55Q8BT07 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cep55Q8BT07 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cep55Q8BT07 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cep55Q8BT07 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cep55Q8BT07 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cep55Q8BT07 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cep55Q8BT07 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cep55Q8BT07 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cep55Q8BT07 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cep55Q8BT07 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cep55Q8BT07 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cep55Q8BT07 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cep55Q8BT07 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cep55Q8BT07 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cep55Q8BT07 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cep55Q8BT07 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cep55Q8BT07 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cep55Q8BT07 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cep55Q8BT07 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cep55Q8BT07 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cep55Q8BT07 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cep55Q8BT07 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cep55Q8BT07 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cep55Q8BT07 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cep55Q8BT07 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cep55Q8BT07 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cep55Q8BT07 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cep55Q8BT07 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cep55Q8BT07 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cep55Q8BT07 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cep55Q8BT07 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cep55Q8BT07 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cep55Q8BT07 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cep55Q8BT07 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cep55Q8BT07 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cep55Q8BT07 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cep55Q8BT07 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cep55Q8BT07 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cep55Q8BT07 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cep55Q8BT07 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cep55Q8BT07 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cep55Q8BT07 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cep55Q8BT07 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cep55Q8BT07 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cep55Q8BT07 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cep55Q8BT07 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cep55Q8BT07 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cep55Q8BT07 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cep55Q8BT07 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cep55Q8BT07 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cep55Q8BT07 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cep55Q8BT07 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cep55Q8BT07 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cep55Q8BT07 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cep55Q8BT07 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cep55Q8BT07 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cep55Q8BT07 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cep55Q8BT07 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cep55Q8BT07 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms