Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSD4

Gjd4, Gap junction delta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd4Q8BSD4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gjd4Q8BSD4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gjd4Q8BSD4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gjd4Q8BSD4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gjd4Q8BSD4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gjd4Q8BSD4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gjd4Q8BSD4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gjd4Q8BSD4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gjd4Q8BSD4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gjd4Q8BSD4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gjd4Q8BSD4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gjd4Q8BSD4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gjd4Q8BSD4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gjd4Q8BSD4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gjd4Q8BSD4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gjd4Q8BSD4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gjd4Q8BSD4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gjd4Q8BSD4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gjd4Q8BSD4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Gjd4Q8BSD4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gjd4Q8BSD4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gjd4Q8BSD4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gjd4Q8BSD4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gjd4Q8BSD4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gjd4Q8BSD4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gjd4Q8BSD4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gjd4Q8BSD4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Gjd4Q8BSD4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gjd4Q8BSD4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gjd4Q8BSD4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Gjd4Q8BSD4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gjd4Q8BSD4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gjd4Q8BSD4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gjd4Q8BSD4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gjd4Q8BSD4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gjd4Q8BSD4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gjd4Q8BSD4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gjd4Q8BSD4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gjd4Q8BSD4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gjd4Q8BSD4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gjd4Q8BSD4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Gjd4Q8BSD4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gjd4Q8BSD4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gjd4Q8BSD4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gjd4Q8BSD4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gjd4Q8BSD4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gjd4Q8BSD4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gjd4Q8BSD4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gjd4Q8BSD4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Gjd4Q8BSD4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gjd4Q8BSD4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gjd4Q8BSD4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gjd4Q8BSD4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gjd4Q8BSD4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gjd4Q8BSD4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gjd4Q8BSD4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gjd4Q8BSD4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gjd4Q8BSD4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Gjd4Q8BSD4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gjd4Q8BSD4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gjd4Q8BSD4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gjd4Q8BSD4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gjd4Q8BSD4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Gjd4Q8BSD4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gjd4Q8BSD4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gjd4Q8BSD4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gjd4Q8BSD4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gjd4Q8BSD4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gjd4Q8BSD4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gjd4Q8BSD4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gjd4Q8BSD4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gjd4Q8BSD4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gjd4Q8BSD4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gjd4Q8BSD4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gjd4Q8BSD4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Gjd4Q8BSD4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gjd4Q8BSD4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gjd4Q8BSD4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gjd4Q8BSD4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gjd4Q8BSD4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gjd4Q8BSD4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gjd4Q8BSD4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gjd4Q8BSD4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gjd4Q8BSD4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gjd4Q8BSD4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gjd4Q8BSD4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gjd4Q8BSD4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gjd4Q8BSD4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gjd4Q8BSD4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gjd4Q8BSD4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Gjd4Q8BSD4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gjd4Q8BSD4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Gjd4Q8BSD4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gjd4Q8BSD4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gjd4Q8BSD4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gjd4Q8BSD4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gjd4Q8BSD4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gjd4Q8BSD4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gjd4Q8BSD4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gjd4Q8BSD4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms