Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR07

Bicd1, Protein bicaudal D homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bicd1Q8BR07 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bicd1Q8BR07 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bicd1Q8BR07 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bicd1Q8BR07 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bicd1Q8BR07 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bicd1Q8BR07 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bicd1Q8BR07 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bicd1Q8BR07 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bicd1Q8BR07 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bicd1Q8BR07 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bicd1Q8BR07 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bicd1Q8BR07 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bicd1Q8BR07 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bicd1Q8BR07 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bicd1Q8BR07 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bicd1Q8BR07 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bicd1Q8BR07 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bicd1Q8BR07 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bicd1Q8BR07 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bicd1Q8BR07 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bicd1Q8BR07 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bicd1Q8BR07 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bicd1Q8BR07 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bicd1Q8BR07 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bicd1Q8BR07 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bicd1Q8BR07 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bicd1Q8BR07 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bicd1Q8BR07 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bicd1Q8BR07 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Bicd1Q8BR07 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bicd1Q8BR07 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bicd1Q8BR07 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bicd1Q8BR07 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bicd1Q8BR07 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bicd1Q8BR07 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bicd1Q8BR07 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bicd1Q8BR07 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bicd1Q8BR07 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Bicd1Q8BR07 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Bicd1Q8BR07 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Bicd1Q8BR07 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Bicd1Q8BR07 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bicd1Q8BR07 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bicd1Q8BR07 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Bicd1Q8BR07 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bicd1Q8BR07 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bicd1Q8BR07 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bicd1Q8BR07 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bicd1Q8BR07 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bicd1Q8BR07 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bicd1Q8BR07 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bicd1Q8BR07 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bicd1Q8BR07 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bicd1Q8BR07 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bicd1Q8BR07 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bicd1Q8BR07 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bicd1Q8BR07 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bicd1Q8BR07 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bicd1Q8BR07 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bicd1Q8BR07 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bicd1Q8BR07 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Bicd1Q8BR07 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bicd1Q8BR07 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bicd1Q8BR07 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bicd1Q8BR07 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bicd1Q8BR07 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bicd1Q8BR07 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bicd1Q8BR07 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bicd1Q8BR07 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bicd1Q8BR07 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bicd1Q8BR07 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bicd1Q8BR07 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bicd1Q8BR07 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bicd1Q8BR07 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bicd1Q8BR07 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bicd1Q8BR07 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bicd1Q8BR07 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bicd1Q8BR07 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Bicd1Q8BR07 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bicd1Q8BR07 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bicd1Q8BR07 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bicd1Q8BR07 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Bicd1Q8BR07 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Bicd1Q8BR07 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Bicd1Q8BR07 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bicd1Q8BR07 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Bicd1Q8BR07 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Bicd1Q8BR07 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Bicd1Q8BR07 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Bicd1Q8BR07 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Bicd1Q8BR07 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bicd1Q8BR07 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bicd1Q8BR07 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bicd1Q8BR07 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bicd1Q8BR07 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bicd1Q8BR07 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bicd1Q8BR07 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bicd1Q8BR07 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bicd1Q8BR07 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bicd1Q8BR07 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms