Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMG1

Atrip, ATR-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtripQ8BMG1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AtripQ8BMG1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AtripQ8BMG1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AtripQ8BMG1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AtripQ8BMG1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AtripQ8BMG1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AtripQ8BMG1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
AtripQ8BMG1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AtripQ8BMG1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AtripQ8BMG1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AtripQ8BMG1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AtripQ8BMG1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AtripQ8BMG1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AtripQ8BMG1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AtripQ8BMG1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AtripQ8BMG1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AtripQ8BMG1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AtripQ8BMG1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AtripQ8BMG1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AtripQ8BMG1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
AtripQ8BMG1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AtripQ8BMG1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AtripQ8BMG1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AtripQ8BMG1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AtripQ8BMG1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AtripQ8BMG1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AtripQ8BMG1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AtripQ8BMG1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AtripQ8BMG1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AtripQ8BMG1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
AtripQ8BMG1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AtripQ8BMG1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AtripQ8BMG1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AtripQ8BMG1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AtripQ8BMG1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AtripQ8BMG1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AtripQ8BMG1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AtripQ8BMG1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AtripQ8BMG1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AtripQ8BMG1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AtripQ8BMG1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AtripQ8BMG1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AtripQ8BMG1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AtripQ8BMG1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AtripQ8BMG1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AtripQ8BMG1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AtripQ8BMG1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AtripQ8BMG1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AtripQ8BMG1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AtripQ8BMG1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AtripQ8BMG1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AtripQ8BMG1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AtripQ8BMG1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AtripQ8BMG1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AtripQ8BMG1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AtripQ8BMG1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AtripQ8BMG1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AtripQ8BMG1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AtripQ8BMG1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
AtripQ8BMG1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
AtripQ8BMG1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AtripQ8BMG1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AtripQ8BMG1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AtripQ8BMG1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AtripQ8BMG1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AtripQ8BMG1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AtripQ8BMG1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AtripQ8BMG1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AtripQ8BMG1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AtripQ8BMG1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AtripQ8BMG1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AtripQ8BMG1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AtripQ8BMG1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AtripQ8BMG1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AtripQ8BMG1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
AtripQ8BMG1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
AtripQ8BMG1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AtripQ8BMG1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AtripQ8BMG1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AtripQ8BMG1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AtripQ8BMG1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AtripQ8BMG1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AtripQ8BMG1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AtripQ8BMG1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AtripQ8BMG1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AtripQ8BMG1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AtripQ8BMG1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AtripQ8BMG1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AtripQ8BMG1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AtripQ8BMG1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AtripQ8BMG1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
AtripQ8BMG1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AtripQ8BMG1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AtripQ8BMG1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AtripQ8BMG1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AtripQ8BMG1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AtripQ8BMG1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AtripQ8BMG1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AtripQ8BMG1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AtripQ8BMG1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms