Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLE7

Slc17a6, Vesicular glutamate transporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc17a6Q8BLE7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc17a6Q8BLE7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc17a6Q8BLE7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc17a6Q8BLE7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc17a6Q8BLE7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc17a6Q8BLE7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc17a6Q8BLE7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc17a6Q8BLE7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc17a6Q8BLE7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc17a6Q8BLE7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc17a6Q8BLE7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc17a6Q8BLE7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc17a6Q8BLE7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc17a6Q8BLE7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc17a6Q8BLE7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc17a6Q8BLE7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc17a6Q8BLE7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc17a6Q8BLE7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc17a6Q8BLE7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc17a6Q8BLE7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc17a6Q8BLE7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc17a6Q8BLE7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc17a6Q8BLE7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc17a6Q8BLE7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc17a6Q8BLE7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc17a6Q8BLE7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc17a6Q8BLE7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc17a6Q8BLE7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc17a6Q8BLE7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc17a6Q8BLE7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc17a6Q8BLE7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc17a6Q8BLE7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc17a6Q8BLE7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc17a6Q8BLE7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc17a6Q8BLE7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc17a6Q8BLE7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc17a6Q8BLE7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc17a6Q8BLE7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc17a6Q8BLE7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc17a6Q8BLE7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc17a6Q8BLE7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc17a6Q8BLE7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc17a6Q8BLE7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc17a6Q8BLE7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc17a6Q8BLE7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc17a6Q8BLE7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms