Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpc2Q8BKV1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpc2Q8BKV1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpc2Q8BKV1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpc2Q8BKV1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpc2Q8BKV1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpc2Q8BKV1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpc2Q8BKV1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpc2Q8BKV1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpc2Q8BKV1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpc2Q8BKV1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpc2Q8BKV1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpc2Q8BKV1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpc2Q8BKV1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpc2Q8BKV1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpc2Q8BKV1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpc2Q8BKV1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpc2Q8BKV1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpc2Q8BKV1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpc2Q8BKV1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpc2Q8BKV1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gpc2Q8BKV1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gpc2Q8BKV1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpc2Q8BKV1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpc2Q8BKV1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpc2Q8BKV1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpc2Q8BKV1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpc2Q8BKV1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpc2Q8BKV1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpc2Q8BKV1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpc2Q8BKV1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpc2Q8BKV1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpc2Q8BKV1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpc2Q8BKV1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpc2Q8BKV1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpc2Q8BKV1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpc2Q8BKV1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpc2Q8BKV1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Gpc2Q8BKV1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gpc2Q8BKV1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gpc2Q8BKV1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gpc2Q8BKV1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gpc2Q8BKV1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gpc2Q8BKV1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gpc2Q8BKV1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gpc2Q8BKV1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gpc2Q8BKV1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gpc2Q8BKV1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gpc2Q8BKV1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gpc2Q8BKV1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gpc2Q8BKV1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gpc2Q8BKV1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gpc2Q8BKV1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gpc2Q8BKV1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gpc2Q8BKV1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gpc2Q8BKV1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gpc2Q8BKV1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gpc2Q8BKV1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gpc2Q8BKV1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gpc2Q8BKV1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gpc2Q8BKV1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gpc2Q8BKV1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gpc2Q8BKV1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gpc2Q8BKV1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gpc2Q8BKV1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gpc2Q8BKV1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gpc2Q8BKV1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gpc2Q8BKV1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gpc2Q8BKV1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gpc2Q8BKV1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gpc2Q8BKV1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Gpc2Q8BKV1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gpc2Q8BKV1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gpc2Q8BKV1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gpc2Q8BKV1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpc2Q8BKV1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpc2Q8BKV1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpc2Q8BKV1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpc2Q8BKV1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpc2Q8BKV1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpc2Q8BKV1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpc2Q8BKV1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpc2Q8BKV1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpc2Q8BKV1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpc2Q8BKV1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpc2Q8BKV1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpc2Q8BKV1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpc2Q8BKV1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpc2Q8BKV1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpc2Q8BKV1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpc2Q8BKV1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpc2Q8BKV1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gpc2Q8BKV1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gpc2Q8BKV1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gpc2Q8BKV1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gpc2Q8BKV1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gpc2Q8BKV1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gpc2Q8BKV1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gpc2Q8BKV1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gpc2Q8BKV1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms