Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
D130040H23RikQ8BII3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
D130040H23RikQ8BII3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
D130040H23RikQ8BII3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
D130040H23RikQ8BII3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
D130040H23RikQ8BII3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
D130040H23RikQ8BII3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
D130040H23RikQ8BII3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
D130040H23RikQ8BII3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
D130040H23RikQ8BII3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
D130040H23RikQ8BII3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
D130040H23RikQ8BII3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
D130040H23RikQ8BII3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
D130040H23RikQ8BII3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
D130040H23RikQ8BII3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
D130040H23RikQ8BII3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
D130040H23RikQ8BII3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
D130040H23RikQ8BII3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
D130040H23RikQ8BII3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
D130040H23RikQ8BII3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
D130040H23RikQ8BII3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
D130040H23RikQ8BII3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
D130040H23RikQ8BII3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
D130040H23RikQ8BII3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
D130040H23RikQ8BII3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
D130040H23RikQ8BII3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
D130040H23RikQ8BII3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
D130040H23RikQ8BII3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
D130040H23RikQ8BII3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
D130040H23RikQ8BII3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
D130040H23RikQ8BII3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
D130040H23RikQ8BII3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
D130040H23RikQ8BII3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
D130040H23RikQ8BII3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
D130040H23RikQ8BII3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
D130040H23RikQ8BII3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
D130040H23RikQ8BII3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
D130040H23RikQ8BII3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
D130040H23RikQ8BII3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
D130040H23RikQ8BII3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
D130040H23RikQ8BII3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
D130040H23RikQ8BII3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
D130040H23RikQ8BII3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
D130040H23RikQ8BII3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
D130040H23RikQ8BII3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
D130040H23RikQ8BII3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
D130040H23RikQ8BII3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
D130040H23RikQ8BII3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
D130040H23RikQ8BII3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
D130040H23RikQ8BII3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
D130040H23RikQ8BII3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
D130040H23RikQ8BII3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
D130040H23RikQ8BII3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
D130040H23RikQ8BII3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
D130040H23RikQ8BII3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
D130040H23RikQ8BII3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
D130040H23RikQ8BII3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
D130040H23RikQ8BII3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
D130040H23RikQ8BII3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
D130040H23RikQ8BII3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
D130040H23RikQ8BII3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
D130040H23RikQ8BII3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
D130040H23RikQ8BII3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
D130040H23RikQ8BII3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
D130040H23RikQ8BII3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
D130040H23RikQ8BII3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
D130040H23RikQ8BII3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
D130040H23RikQ8BII3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
D130040H23RikQ8BII3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
D130040H23RikQ8BII3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
D130040H23RikQ8BII3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
D130040H23RikQ8BII3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
D130040H23RikQ8BII3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
D130040H23RikQ8BII3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
D130040H23RikQ8BII3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
D130040H23RikQ8BII3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
D130040H23RikQ8BII3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
D130040H23RikQ8BII3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
D130040H23RikQ8BII3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
D130040H23RikQ8BII3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
D130040H23RikQ8BII3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
D130040H23RikQ8BII3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
D130040H23RikQ8BII3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
D130040H23RikQ8BII3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
D130040H23RikQ8BII3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
D130040H23RikQ8BII3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
D130040H23RikQ8BII3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
D130040H23RikQ8BII3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
D130040H23RikQ8BII3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
D130040H23RikQ8BII3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
D130040H23RikQ8BII3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
D130040H23RikQ8BII3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
D130040H23RikQ8BII3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
D130040H23RikQ8BII3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
D130040H23RikQ8BII3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
D130040H23RikQ8BII3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
D130040H23RikQ8BII3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
D130040H23RikQ8BII3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
D130040H23RikQ8BII3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
D130040H23RikQ8BII3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms