Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Best2Q8BGM5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Best2Q8BGM5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Best2Q8BGM5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Best2Q8BGM5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Best2Q8BGM5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Best2Q8BGM5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Best2Q8BGM5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Best2Q8BGM5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Best2Q8BGM5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Best2Q8BGM5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Best2Q8BGM5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Best2Q8BGM5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Best2Q8BGM5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Best2Q8BGM5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Best2Q8BGM5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Best2Q8BGM5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Best2Q8BGM5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Best2Q8BGM5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Best2Q8BGM5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Best2Q8BGM5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Best2Q8BGM5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Best2Q8BGM5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Best2Q8BGM5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Best2Q8BGM5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Best2Q8BGM5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Best2Q8BGM5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Best2Q8BGM5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Best2Q8BGM5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Best2Q8BGM5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Best2Q8BGM5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Best2Q8BGM5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Best2Q8BGM5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Best2Q8BGM5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Best2Q8BGM5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Best2Q8BGM5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Best2Q8BGM5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Best2Q8BGM5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Best2Q8BGM5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Best2Q8BGM5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Best2Q8BGM5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Best2Q8BGM5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Best2Q8BGM5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Best2Q8BGM5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Best2Q8BGM5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms