Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2af1l4Q8BGJ9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2af1l4Q8BGJ9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2af1l4Q8BGJ9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2af1l4Q8BGJ9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2af1l4Q8BGJ9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2af1l4Q8BGJ9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
U2af1l4Q8BGJ9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2af1l4Q8BGJ9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2af1l4Q8BGJ9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2af1l4Q8BGJ9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2af1l4Q8BGJ9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2af1l4Q8BGJ9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2af1l4Q8BGJ9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2af1l4Q8BGJ9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2af1l4Q8BGJ9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2af1l4Q8BGJ9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2af1l4Q8BGJ9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
U2af1l4Q8BGJ9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
U2af1l4Q8BGJ9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
U2af1l4Q8BGJ9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
U2af1l4Q8BGJ9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
U2af1l4Q8BGJ9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
U2af1l4Q8BGJ9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
U2af1l4Q8BGJ9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
U2af1l4Q8BGJ9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
U2af1l4Q8BGJ9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
U2af1l4Q8BGJ9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
U2af1l4Q8BGJ9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2af1l4Q8BGJ9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2af1l4Q8BGJ9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2af1l4Q8BGJ9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2af1l4Q8BGJ9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2af1l4Q8BGJ9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2af1l4Q8BGJ9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2af1l4Q8BGJ9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
U2af1l4Q8BGJ9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
U2af1l4Q8BGJ9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
U2af1l4Q8BGJ9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
U2af1l4Q8BGJ9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
U2af1l4Q8BGJ9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
U2af1l4Q8BGJ9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
U2af1l4Q8BGJ9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
U2af1l4Q8BGJ9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2af1l4Q8BGJ9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2af1l4Q8BGJ9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2af1l4Q8BGJ9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
U2af1l4Q8BGJ9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2af1l4Q8BGJ9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2af1l4Q8BGJ9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
U2af1l4Q8BGJ9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
U2af1l4Q8BGJ9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
U2af1l4Q8BGJ9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
U2af1l4Q8BGJ9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2af1l4Q8BGJ9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2af1l4Q8BGJ9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2af1l4Q8BGJ9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2af1l4Q8BGJ9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2af1l4Q8BGJ9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2af1l4Q8BGJ9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2af1l4Q8BGJ9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2af1l4Q8BGJ9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2af1l4Q8BGJ9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2af1l4Q8BGJ9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
U2af1l4Q8BGJ9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
U2af1l4Q8BGJ9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
U2af1l4Q8BGJ9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
U2af1l4Q8BGJ9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
U2af1l4Q8BGJ9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
U2af1l4Q8BGJ9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
U2af1l4Q8BGJ9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2af1l4Q8BGJ9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2af1l4Q8BGJ9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2af1l4Q8BGJ9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2af1l4Q8BGJ9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
U2af1l4Q8BGJ9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
U2af1l4Q8BGJ9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2af1l4Q8BGJ9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2af1l4Q8BGJ9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2af1l4Q8BGJ9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2af1l4Q8BGJ9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2af1l4Q8BGJ9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2af1l4Q8BGJ9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2af1l4Q8BGJ9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2af1l4Q8BGJ9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2af1l4Q8BGJ9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2af1l4Q8BGJ9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2af1l4Q8BGJ9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2af1l4Q8BGJ9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2af1l4Q8BGJ9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2af1l4Q8BGJ9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2af1l4Q8BGJ9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2af1l4Q8BGJ9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2af1l4Q8BGJ9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2af1l4Q8BGJ9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2af1l4Q8BGJ9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms