Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim6Q8BGE7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim6Q8BGE7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim6Q8BGE7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim6Q8BGE7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim6Q8BGE7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim6Q8BGE7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim6Q8BGE7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim6Q8BGE7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim6Q8BGE7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim6Q8BGE7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim6Q8BGE7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim6Q8BGE7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim6Q8BGE7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim6Q8BGE7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim6Q8BGE7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim6Q8BGE7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim6Q8BGE7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim6Q8BGE7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim6Q8BGE7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim6Q8BGE7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim6Q8BGE7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim6Q8BGE7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim6Q8BGE7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim6Q8BGE7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim6Q8BGE7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim6Q8BGE7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim6Q8BGE7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim6Q8BGE7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim6Q8BGE7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim6Q8BGE7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim6Q8BGE7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim6Q8BGE7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim6Q8BGE7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim6Q8BGE7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim6Q8BGE7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim6Q8BGE7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim6Q8BGE7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim6Q8BGE7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim6Q8BGE7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim6Q8BGE7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim6Q8BGE7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim6Q8BGE7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim6Q8BGE7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim6Q8BGE7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim6Q8BGE7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim6Q8BGE7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim6Q8BGE7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim6Q8BGE7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim6Q8BGE7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim6Q8BGE7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim6Q8BGE7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim6Q8BGE7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim6Q8BGE7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim6Q8BGE7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim6Q8BGE7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim6Q8BGE7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim6Q8BGE7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim6Q8BGE7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim6Q8BGE7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim6Q8BGE7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim6Q8BGE7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim6Q8BGE7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim6Q8BGE7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim6Q8BGE7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim6Q8BGE7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim6Q8BGE7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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