Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrrtm2Q8BGA3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lrrtm2Q8BGA3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrrtm2Q8BGA3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrtm2Q8BGA3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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