Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG39

Sv2b, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2bQ8BG39 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sv2bQ8BG39 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sv2bQ8BG39 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sv2bQ8BG39 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sv2bQ8BG39 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sv2bQ8BG39 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sv2bQ8BG39 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sv2bQ8BG39 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sv2bQ8BG39 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sv2bQ8BG39 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sv2bQ8BG39 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sv2bQ8BG39 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sv2bQ8BG39 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sv2bQ8BG39 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sv2bQ8BG39 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sv2bQ8BG39 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sv2bQ8BG39 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sv2bQ8BG39 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sv2bQ8BG39 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sv2bQ8BG39 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sv2bQ8BG39 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Sv2bQ8BG39 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Sv2bQ8BG39 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sv2bQ8BG39 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sv2bQ8BG39 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sv2bQ8BG39 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sv2bQ8BG39 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sv2bQ8BG39 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sv2bQ8BG39 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sv2bQ8BG39 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sv2bQ8BG39 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sv2bQ8BG39 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sv2bQ8BG39 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sv2bQ8BG39 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sv2bQ8BG39 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sv2bQ8BG39 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sv2bQ8BG39 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sv2bQ8BG39 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sv2bQ8BG39 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sv2bQ8BG39 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sv2bQ8BG39 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Sv2bQ8BG39 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sv2bQ8BG39 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sv2bQ8BG39 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sv2bQ8BG39 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sv2bQ8BG39 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sv2bQ8BG39 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sv2bQ8BG39 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sv2bQ8BG39 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sv2bQ8BG39 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sv2bQ8BG39 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sv2bQ8BG39 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sv2bQ8BG39 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sv2bQ8BG39 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sv2bQ8BG39 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sv2bQ8BG39 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sv2bQ8BG39 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sv2bQ8BG39 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sv2bQ8BG39 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sv2bQ8BG39 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sv2bQ8BG39 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Sv2bQ8BG39 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sv2bQ8BG39 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sv2bQ8BG39 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sv2bQ8BG39 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sv2bQ8BG39 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sv2bQ8BG39 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sv2bQ8BG39 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sv2bQ8BG39 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sv2bQ8BG39 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Sv2bQ8BG39 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sv2bQ8BG39 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sv2bQ8BG39 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Sv2bQ8BG39 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sv2bQ8BG39 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sv2bQ8BG39 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sv2bQ8BG39 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sv2bQ8BG39 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sv2bQ8BG39 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sv2bQ8BG39 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sv2bQ8BG39 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sv2bQ8BG39 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sv2bQ8BG39 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sv2bQ8BG39 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sv2bQ8BG39 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sv2bQ8BG39 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sv2bQ8BG39 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sv2bQ8BG39 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sv2bQ8BG39 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sv2bQ8BG39 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sv2bQ8BG39 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sv2bQ8BG39 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
Sv2bQ8BG39 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sv2bQ8BG39 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sv2bQ8BG39 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sv2bQ8BG39 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sv2bQ8BG39 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sv2bQ8BG39 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sv2bQ8BG39 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sv2bQ8BG39 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms