Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFW4

Trim65, Tripartite motif-containing protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim65Q8BFW4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim65Q8BFW4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim65Q8BFW4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim65Q8BFW4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim65Q8BFW4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim65Q8BFW4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim65Q8BFW4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim65Q8BFW4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim65Q8BFW4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim65Q8BFW4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim65Q8BFW4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim65Q8BFW4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim65Q8BFW4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim65Q8BFW4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim65Q8BFW4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim65Q8BFW4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim65Q8BFW4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim65Q8BFW4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim65Q8BFW4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim65Q8BFW4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim65Q8BFW4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim65Q8BFW4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim65Q8BFW4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim65Q8BFW4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim65Q8BFW4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim65Q8BFW4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim65Q8BFW4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim65Q8BFW4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim65Q8BFW4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim65Q8BFW4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim65Q8BFW4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim65Q8BFW4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim65Q8BFW4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim65Q8BFW4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim65Q8BFW4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim65Q8BFW4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim65Q8BFW4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim65Q8BFW4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim65Q8BFW4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim65Q8BFW4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim65Q8BFW4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim65Q8BFW4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim65Q8BFW4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim65Q8BFW4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim65Q8BFW4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim65Q8BFW4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim65Q8BFW4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim65Q8BFW4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim65Q8BFW4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim65Q8BFW4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim65Q8BFW4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim65Q8BFW4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim65Q8BFW4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim65Q8BFW4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim65Q8BFW4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim65Q8BFW4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim65Q8BFW4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim65Q8BFW4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim65Q8BFW4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim65Q8BFW4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim65Q8BFW4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim65Q8BFW4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim65Q8BFW4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim65Q8BFW4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim65Q8BFW4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim65Q8BFW4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim65Q8BFW4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim65Q8BFW4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim65Q8BFW4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim65Q8BFW4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim65Q8BFW4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim65Q8BFW4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim65Q8BFW4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim65Q8BFW4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim65Q8BFW4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim65Q8BFW4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim65Q8BFW4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim65Q8BFW4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim65Q8BFW4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim65Q8BFW4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim65Q8BFW4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim65Q8BFW4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim65Q8BFW4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim65Q8BFW4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim65Q8BFW4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim65Q8BFW4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim65Q8BFW4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim65Q8BFW4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim65Q8BFW4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim65Q8BFW4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim65Q8BFW4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim65Q8BFW4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim65Q8BFW4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim65Q8BFW4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim65Q8BFW4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim65Q8BFW4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim65Q8BFW4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim65Q8BFW4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim65Q8BFW4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim65Q8BFW4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms