Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2-M10.4Q85ZW8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-M10.4Q85ZW8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18■□□□□ 0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M10.4Q85ZW8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms