Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ChfrQ810L3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ChfrQ810L3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ChfrQ810L3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ChfrQ810L3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChfrQ810L3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChfrQ810L3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChfrQ810L3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChfrQ810L3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChfrQ810L3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChfrQ810L3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChfrQ810L3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ChfrQ810L3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ChfrQ810L3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ChfrQ810L3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ChfrQ810L3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ChfrQ810L3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ChfrQ810L3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ChfrQ810L3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ChfrQ810L3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ChfrQ810L3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ChfrQ810L3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ChfrQ810L3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChfrQ810L3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChfrQ810L3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChfrQ810L3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChfrQ810L3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChfrQ810L3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChfrQ810L3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChfrQ810L3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChfrQ810L3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChfrQ810L3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChfrQ810L3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChfrQ810L3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ChfrQ810L3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ChfrQ810L3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms