Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cracr2bQ80ZJ8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cracr2bQ80ZJ8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Cracr2bQ80ZJ8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cracr2bQ80ZJ8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cracr2bQ80ZJ8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cracr2bQ80ZJ8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cracr2bQ80ZJ8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cracr2bQ80ZJ8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cracr2bQ80ZJ8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cracr2bQ80ZJ8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cracr2bQ80ZJ8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cracr2bQ80ZJ8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Cracr2bQ80ZJ8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cracr2bQ80ZJ8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cracr2bQ80ZJ8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cracr2bQ80ZJ8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cracr2bQ80ZJ8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cracr2bQ80ZJ8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cracr2bQ80ZJ8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cracr2bQ80ZJ8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cracr2bQ80ZJ8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cracr2bQ80ZJ8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cracr2bQ80ZJ8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cracr2bQ80ZJ8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cracr2bQ80ZJ8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cracr2bQ80ZJ8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cracr2bQ80ZJ8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cracr2bQ80ZJ8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cracr2bQ80ZJ8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cracr2bQ80ZJ8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cracr2bQ80ZJ8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cracr2bQ80ZJ8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cracr2bQ80ZJ8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cracr2bQ80ZJ8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cracr2bQ80ZJ8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Cracr2bQ80ZJ8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cracr2bQ80ZJ8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cracr2bQ80ZJ8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cracr2bQ80ZJ8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Cracr2bQ80ZJ8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cracr2bQ80ZJ8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cracr2bQ80ZJ8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cracr2bQ80ZJ8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cracr2bQ80ZJ8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cracr2bQ80ZJ8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cracr2bQ80ZJ8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cracr2bQ80ZJ8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cracr2bQ80ZJ8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cracr2bQ80ZJ8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cracr2bQ80ZJ8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cracr2bQ80ZJ8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cracr2bQ80ZJ8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cracr2bQ80ZJ8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cracr2bQ80ZJ8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cracr2bQ80ZJ8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cracr2bQ80ZJ8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cracr2bQ80ZJ8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cracr2bQ80ZJ8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cracr2bQ80ZJ8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cracr2bQ80ZJ8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cracr2bQ80ZJ8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cracr2bQ80ZJ8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cracr2bQ80ZJ8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cracr2bQ80ZJ8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cracr2bQ80ZJ8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cracr2bQ80ZJ8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cracr2bQ80ZJ8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cracr2bQ80ZJ8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cracr2bQ80ZJ8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cracr2bQ80ZJ8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cracr2bQ80ZJ8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cracr2bQ80ZJ8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cracr2bQ80ZJ8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cracr2bQ80ZJ8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cracr2bQ80ZJ8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cracr2bQ80ZJ8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cracr2bQ80ZJ8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cracr2bQ80ZJ8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cracr2bQ80ZJ8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cracr2bQ80ZJ8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cracr2bQ80ZJ8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cracr2bQ80ZJ8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cracr2bQ80ZJ8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cracr2bQ80ZJ8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cracr2bQ80ZJ8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cracr2bQ80ZJ8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cracr2bQ80ZJ8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cracr2bQ80ZJ8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cracr2bQ80ZJ8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cracr2bQ80ZJ8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cracr2bQ80ZJ8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cracr2bQ80ZJ8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cracr2bQ80ZJ8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cracr2bQ80ZJ8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.3 ms