Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Amigo1Q80ZD8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Amigo1Q80ZD8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Amigo1Q80ZD8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Amigo1Q80ZD8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Amigo1Q80ZD8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Amigo1Q80ZD8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Amigo1Q80ZD8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Amigo1Q80ZD8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Amigo1Q80ZD8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Amigo1Q80ZD8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Amigo1Q80ZD8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Amigo1Q80ZD8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Amigo1Q80ZD8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Amigo1Q80ZD8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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Amigo1Q80ZD8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Amigo1Q80ZD8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Amigo1Q80ZD8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Amigo1Q80ZD8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Amigo1Q80ZD8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Amigo1Q80ZD8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Amigo1Q80ZD8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Amigo1Q80ZD8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Amigo1Q80ZD8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Amigo1Q80ZD8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Amigo1Q80ZD8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Amigo1Q80ZD8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Amigo1Q80ZD8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Amigo1Q80ZD8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Amigo1Q80ZD8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Amigo1Q80ZD8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Amigo1Q80ZD8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Amigo1Q80ZD8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Amigo1Q80ZD8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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Amigo1Q80ZD8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Amigo1Q80ZD8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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Amigo1Q80ZD8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Amigo1Q80ZD8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Amigo1Q80ZD8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Amigo1Q80ZD8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Amigo1Q80ZD8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Amigo1Q80ZD8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Amigo1Q80ZD8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Amigo1Q80ZD8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Amigo1Q80ZD8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Amigo1Q80ZD8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Amigo1Q80ZD8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Amigo1Q80ZD8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Amigo1Q80ZD8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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Amigo1Q80ZD8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Amigo1Q80ZD8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
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Amigo1Q80ZD8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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Amigo1Q80ZD8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Amigo1Q80ZD8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Amigo1Q80ZD8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Amigo1Q80ZD8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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Amigo1Q80ZD8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Amigo1Q80ZD8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Amigo1Q80ZD8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Amigo1Q80ZD8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Amigo1Q80ZD8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Amigo1Q80ZD8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Amigo1Q80ZD8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Amigo1Q80ZD8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Amigo1Q80ZD8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Amigo1Q80ZD8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Amigo1Q80ZD8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Amigo1Q80ZD8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Amigo1Q80ZD8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Amigo1Q80ZD8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Amigo1Q80ZD8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Amigo1Q80ZD8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Amigo1Q80ZD8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Amigo1Q80ZD8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Amigo1Q80ZD8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Amigo1Q80ZD8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Amigo1Q80ZD8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Amigo1Q80ZD8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Amigo1Q80ZD8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Amigo1Q80ZD8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Amigo1Q80ZD8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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