Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc28Q80XJ3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc28Q80XJ3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc28Q80XJ3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc28Q80XJ3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc28Q80XJ3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc28Q80XJ3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc28Q80XJ3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc28Q80XJ3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc28Q80XJ3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc28Q80XJ3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc28Q80XJ3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc28Q80XJ3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc28Q80XJ3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc28Q80XJ3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc28Q80XJ3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc28Q80XJ3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc28Q80XJ3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc28Q80XJ3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc28Q80XJ3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc28Q80XJ3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc28Q80XJ3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc28Q80XJ3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc28Q80XJ3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc28Q80XJ3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc28Q80XJ3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc28Q80XJ3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc28Q80XJ3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc28Q80XJ3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc28Q80XJ3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc28Q80XJ3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc28Q80XJ3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc28Q80XJ3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc28Q80XJ3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttc28Q80XJ3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttc28Q80XJ3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttc28Q80XJ3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttc28Q80XJ3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttc28Q80XJ3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttc28Q80XJ3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttc28Q80XJ3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc28Q80XJ3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ttc28Q80XJ3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ttc28Q80XJ3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ttc28Q80XJ3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
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