Protein–RNA interactions for Protein: Q80UW8

Polr2e, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2eQ80UW8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr2eQ80UW8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr2eQ80UW8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr2eQ80UW8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr2eQ80UW8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr2eQ80UW8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr2eQ80UW8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr2eQ80UW8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr2eQ80UW8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr2eQ80UW8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr2eQ80UW8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr2eQ80UW8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr2eQ80UW8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr2eQ80UW8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr2eQ80UW8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr2eQ80UW8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr2eQ80UW8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr2eQ80UW8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr2eQ80UW8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr2eQ80UW8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr2eQ80UW8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr2eQ80UW8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr2eQ80UW8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr2eQ80UW8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr2eQ80UW8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr2eQ80UW8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr2eQ80UW8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr2eQ80UW8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr2eQ80UW8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr2eQ80UW8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr2eQ80UW8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr2eQ80UW8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr2eQ80UW8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr2eQ80UW8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr2eQ80UW8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr2eQ80UW8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr2eQ80UW8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr2eQ80UW8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr2eQ80UW8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr2eQ80UW8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr2eQ80UW8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr2eQ80UW8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr2eQ80UW8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr2eQ80UW8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Polr2eQ80UW8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Polr2eQ80UW8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Polr2eQ80UW8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Polr2eQ80UW8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Polr2eQ80UW8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Polr2eQ80UW8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2eQ80UW8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2eQ80UW8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2eQ80UW8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2eQ80UW8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2eQ80UW8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2eQ80UW8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2eQ80UW8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2eQ80UW8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2eQ80UW8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2eQ80UW8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr2eQ80UW8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr2eQ80UW8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr2eQ80UW8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr2eQ80UW8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr2eQ80UW8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr2eQ80UW8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr2eQ80UW8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr2eQ80UW8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr2eQ80UW8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr2eQ80UW8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr2eQ80UW8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr2eQ80UW8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr2eQ80UW8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr2eQ80UW8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr2eQ80UW8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr2eQ80UW8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr2eQ80UW8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr2eQ80UW8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr2eQ80UW8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr2eQ80UW8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr2eQ80UW8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr2eQ80UW8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr2eQ80UW8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr2eQ80UW8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr2eQ80UW8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr2eQ80UW8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr2eQ80UW8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr2eQ80UW8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Polr2eQ80UW8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr2eQ80UW8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr2eQ80UW8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr2eQ80UW8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr2eQ80UW8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr2eQ80UW8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr2eQ80UW8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr2eQ80UW8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr2eQ80UW8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr2eQ80UW8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr2eQ80UW8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr2eQ80UW8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms