Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf18Q7TS55 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf18Q7TS55 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfsf18Q7TS55 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf18Q7TS55 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf18Q7TS55 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf18Q7TS55 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf18Q7TS55 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf18Q7TS55 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf18Q7TS55 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf18Q7TS55 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf18Q7TS55 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfsf18Q7TS55 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf18Q7TS55 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf18Q7TS55 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf18Q7TS55 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf18Q7TS55 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf18Q7TS55 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf18Q7TS55 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf18Q7TS55 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnfsf18Q7TS55 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf18Q7TS55 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf18Q7TS55 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf18Q7TS55 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf18Q7TS55 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnfsf18Q7TS55 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf18Q7TS55 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf18Q7TS55 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf18Q7TS55 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf18Q7TS55 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf18Q7TS55 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf18Q7TS55 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf18Q7TS55 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf18Q7TS55 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf18Q7TS55 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf18Q7TS55 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnfsf18Q7TS55 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Tnfsf18Q7TS55 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfsf18Q7TS55 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms