Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ33

Rgmb, RGM domain family member B, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmbQ7TQ33 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RgmbQ7TQ33 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RgmbQ7TQ33 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RgmbQ7TQ33 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RgmbQ7TQ33 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RgmbQ7TQ33 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RgmbQ7TQ33 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RgmbQ7TQ33 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RgmbQ7TQ33 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RgmbQ7TQ33 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RgmbQ7TQ33 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RgmbQ7TQ33 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RgmbQ7TQ33 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RgmbQ7TQ33 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RgmbQ7TQ33 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RgmbQ7TQ33 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RgmbQ7TQ33 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RgmbQ7TQ33 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RgmbQ7TQ33 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RgmbQ7TQ33 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RgmbQ7TQ33 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RgmbQ7TQ33 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RgmbQ7TQ33 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RgmbQ7TQ33 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RgmbQ7TQ33 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RgmbQ7TQ33 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
RgmbQ7TQ33 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RgmbQ7TQ33 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RgmbQ7TQ33 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
RgmbQ7TQ33 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RgmbQ7TQ33 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RgmbQ7TQ33 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RgmbQ7TQ33 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RgmbQ7TQ33 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RgmbQ7TQ33 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RgmbQ7TQ33 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RgmbQ7TQ33 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RgmbQ7TQ33 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RgmbQ7TQ33 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RgmbQ7TQ33 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RgmbQ7TQ33 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RgmbQ7TQ33 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RgmbQ7TQ33 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RgmbQ7TQ33 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RgmbQ7TQ33 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RgmbQ7TQ33 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RgmbQ7TQ33 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RgmbQ7TQ33 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RgmbQ7TQ33 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RgmbQ7TQ33 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RgmbQ7TQ33 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RgmbQ7TQ33 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RgmbQ7TQ33 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RgmbQ7TQ33 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RgmbQ7TQ33 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RgmbQ7TQ33 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RgmbQ7TQ33 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RgmbQ7TQ33 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RgmbQ7TQ33 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RgmbQ7TQ33 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RgmbQ7TQ33 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RgmbQ7TQ33 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RgmbQ7TQ33 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RgmbQ7TQ33 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RgmbQ7TQ33 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RgmbQ7TQ33 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RgmbQ7TQ33 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RgmbQ7TQ33 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RgmbQ7TQ33 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RgmbQ7TQ33 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RgmbQ7TQ33 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RgmbQ7TQ33 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RgmbQ7TQ33 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RgmbQ7TQ33 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RgmbQ7TQ33 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RgmbQ7TQ33 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RgmbQ7TQ33 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RgmbQ7TQ33 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RgmbQ7TQ33 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RgmbQ7TQ33 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RgmbQ7TQ33 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RgmbQ7TQ33 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RgmbQ7TQ33 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RgmbQ7TQ33 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RgmbQ7TQ33 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RgmbQ7TQ33 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RgmbQ7TQ33 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RgmbQ7TQ33 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RgmbQ7TQ33 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RgmbQ7TQ33 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RgmbQ7TQ33 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RgmbQ7TQ33 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RgmbQ7TQ33 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RgmbQ7TQ33 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RgmbQ7TQ33 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RgmbQ7TQ33 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RgmbQ7TQ33 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RgmbQ7TQ33 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RgmbQ7TQ33 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RgmbQ7TQ33 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms