Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Actn1Q7TPR4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Actn1Q7TPR4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Actn1Q7TPR4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Actn1Q7TPR4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Actn1Q7TPR4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Actn1Q7TPR4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Actn1Q7TPR4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Actn1Q7TPR4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Actn1Q7TPR4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Actn1Q7TPR4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Actn1Q7TPR4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Actn1Q7TPR4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Actn1Q7TPR4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Actn1Q7TPR4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Actn1Q7TPR4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Actn1Q7TPR4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Actn1Q7TPR4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Actn1Q7TPR4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Actn1Q7TPR4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Actn1Q7TPR4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Actn1Q7TPR4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Actn1Q7TPR4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Actn1Q7TPR4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Actn1Q7TPR4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Actn1Q7TPR4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Actn1Q7TPR4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Actn1Q7TPR4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Actn1Q7TPR4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Actn1Q7TPR4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Actn1Q7TPR4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Actn1Q7TPR4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Actn1Q7TPR4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Actn1Q7TPR4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Actn1Q7TPR4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Actn1Q7TPR4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Actn1Q7TPR4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Actn1Q7TPR4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Actn1Q7TPR4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Actn1Q7TPR4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Actn1Q7TPR4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Actn1Q7TPR4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Actn1Q7TPR4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Actn1Q7TPR4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Actn1Q7TPR4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Actn1Q7TPR4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Actn1Q7TPR4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Actn1Q7TPR4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Actn1Q7TPR4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Actn1Q7TPR4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Actn1Q7TPR4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Actn1Q7TPR4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Actn1Q7TPR4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Actn1Q7TPR4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Actn1Q7TPR4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Actn1Q7TPR4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Actn1Q7TPR4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Actn1Q7TPR4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Actn1Q7TPR4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Actn1Q7TPR4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Actn1Q7TPR4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Actn1Q7TPR4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Actn1Q7TPR4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Actn1Q7TPR4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Actn1Q7TPR4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Actn1Q7TPR4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Actn1Q7TPR4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Actn1Q7TPR4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Actn1Q7TPR4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Actn1Q7TPR4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Actn1Q7TPR4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Actn1Q7TPR4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Actn1Q7TPR4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Actn1Q7TPR4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Actn1Q7TPR4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Actn1Q7TPR4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Actn1Q7TPR4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Actn1Q7TPR4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Actn1Q7TPR4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Actn1Q7TPR4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Actn1Q7TPR4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Actn1Q7TPR4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Actn1Q7TPR4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Actn1Q7TPR4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Actn1Q7TPR4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Actn1Q7TPR4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Actn1Q7TPR4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Actn1Q7TPR4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Actn1Q7TPR4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Actn1Q7TPR4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Actn1Q7TPR4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Actn1Q7TPR4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Actn1Q7TPR4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Actn1Q7TPR4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Actn1Q7TPR4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Actn1Q7TPR4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Actn1Q7TPR4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Actn1Q7TPR4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Actn1Q7TPR4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Actn1Q7TPR4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms