Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN29

Smap2, Stromal membrane-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smap2Q7TN29 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smap2Q7TN29 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smap2Q7TN29 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smap2Q7TN29 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smap2Q7TN29 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smap2Q7TN29 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smap2Q7TN29 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smap2Q7TN29 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smap2Q7TN29 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smap2Q7TN29 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smap2Q7TN29 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smap2Q7TN29 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smap2Q7TN29 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smap2Q7TN29 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smap2Q7TN29 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smap2Q7TN29 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smap2Q7TN29 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smap2Q7TN29 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smap2Q7TN29 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smap2Q7TN29 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Smap2Q7TN29 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smap2Q7TN29 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smap2Q7TN29 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smap2Q7TN29 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smap2Q7TN29 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smap2Q7TN29 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smap2Q7TN29 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smap2Q7TN29 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smap2Q7TN29 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smap2Q7TN29 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smap2Q7TN29 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smap2Q7TN29 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Smap2Q7TN29 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smap2Q7TN29 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smap2Q7TN29 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smap2Q7TN29 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smap2Q7TN29 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smap2Q7TN29 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smap2Q7TN29 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smap2Q7TN29 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smap2Q7TN29 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Smap2Q7TN29 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smap2Q7TN29 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smap2Q7TN29 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smap2Q7TN29 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smap2Q7TN29 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smap2Q7TN29 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smap2Q7TN29 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smap2Q7TN29 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smap2Q7TN29 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Smap2Q7TN29 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smap2Q7TN29 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smap2Q7TN29 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smap2Q7TN29 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smap2Q7TN29 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smap2Q7TN29 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smap2Q7TN29 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smap2Q7TN29 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smap2Q7TN29 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smap2Q7TN29 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smap2Q7TN29 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smap2Q7TN29 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smap2Q7TN29 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smap2Q7TN29 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smap2Q7TN29 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smap2Q7TN29 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smap2Q7TN29 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smap2Q7TN29 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smap2Q7TN29 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smap2Q7TN29 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smap2Q7TN29 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smap2Q7TN29 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smap2Q7TN29 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smap2Q7TN29 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smap2Q7TN29 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smap2Q7TN29 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smap2Q7TN29 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Smap2Q7TN29 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smap2Q7TN29 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smap2Q7TN29 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smap2Q7TN29 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smap2Q7TN29 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smap2Q7TN29 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smap2Q7TN29 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smap2Q7TN29 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smap2Q7TN29 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smap2Q7TN29 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smap2Q7TN29 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smap2Q7TN29 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Smap2Q7TN29 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smap2Q7TN29 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smap2Q7TN29 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smap2Q7TN29 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smap2Q7TN29 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smap2Q7TN29 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smap2Q7TN29 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smap2Q7TN29 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smap2Q7TN29 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smap2Q7TN29 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smap2Q7TN29 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms