Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Uhrf2Q7TMI3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uhrf2Q7TMI3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms