Protein–RNA interactions for Protein: Q78J03

Msrb2, Methionine-R-sulfoxide reductase B2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb2Q78J03 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msrb2Q78J03 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msrb2Q78J03 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Msrb2Q78J03 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msrb2Q78J03 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msrb2Q78J03 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msrb2Q78J03 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msrb2Q78J03 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msrb2Q78J03 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msrb2Q78J03 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msrb2Q78J03 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msrb2Q78J03 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msrb2Q78J03 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msrb2Q78J03 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msrb2Q78J03 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msrb2Q78J03 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msrb2Q78J03 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msrb2Q78J03 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msrb2Q78J03 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msrb2Q78J03 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msrb2Q78J03 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msrb2Q78J03 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msrb2Q78J03 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msrb2Q78J03 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msrb2Q78J03 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Msrb2Q78J03 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msrb2Q78J03 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msrb2Q78J03 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msrb2Q78J03 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msrb2Q78J03 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msrb2Q78J03 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msrb2Q78J03 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msrb2Q78J03 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msrb2Q78J03 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msrb2Q78J03 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msrb2Q78J03 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msrb2Q78J03 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msrb2Q78J03 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msrb2Q78J03 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msrb2Q78J03 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msrb2Q78J03 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msrb2Q78J03 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msrb2Q78J03 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msrb2Q78J03 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Msrb2Q78J03 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Msrb2Q78J03 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Msrb2Q78J03 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msrb2Q78J03 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Msrb2Q78J03 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msrb2Q78J03 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Msrb2Q78J03 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msrb2Q78J03 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msrb2Q78J03 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msrb2Q78J03 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msrb2Q78J03 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Msrb2Q78J03 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msrb2Q78J03 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msrb2Q78J03 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msrb2Q78J03 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Msrb2Q78J03 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msrb2Q78J03 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msrb2Q78J03 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msrb2Q78J03 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Msrb2Q78J03 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Msrb2Q78J03 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Msrb2Q78J03 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Msrb2Q78J03 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Msrb2Q78J03 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Msrb2Q78J03 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Msrb2Q78J03 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Msrb2Q78J03 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Msrb2Q78J03 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Msrb2Q78J03 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Msrb2Q78J03 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Msrb2Q78J03 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Msrb2Q78J03 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Msrb2Q78J03 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Msrb2Q78J03 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Msrb2Q78J03 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Msrb2Q78J03 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Msrb2Q78J03 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Msrb2Q78J03 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Msrb2Q78J03 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Msrb2Q78J03 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Msrb2Q78J03 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Msrb2Q78J03 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Msrb2Q78J03 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Msrb2Q78J03 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Msrb2Q78J03 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Msrb2Q78J03 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Msrb2Q78J03 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Msrb2Q78J03 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Msrb2Q78J03 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Msrb2Q78J03 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Msrb2Q78J03 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Msrb2Q78J03 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Msrb2Q78J03 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Msrb2Q78J03 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Msrb2Q78J03 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Msrb2Q78J03 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.4 ms