Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Higd1cQ76I25 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms