Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nme8Q715T0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Nme8Q715T0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nme8Q715T0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nme8Q715T0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nme8Q715T0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nme8Q715T0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nme8Q715T0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Nme8Q715T0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nme8Q715T0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nme8Q715T0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nme8Q715T0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nme8Q715T0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nme8Q715T0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Nme8Q715T0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Nme8Q715T0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Nme8Q715T0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nme8Q715T0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Nme8Q715T0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nme8Q715T0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nme8Q715T0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nme8Q715T0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nme8Q715T0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nme8Q715T0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nme8Q715T0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nme8Q715T0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nme8Q715T0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nme8Q715T0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Nme8Q715T0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nme8Q715T0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nme8Q715T0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nme8Q715T0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Nme8Q715T0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nme8Q715T0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nme8Q715T0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nme8Q715T0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nme8Q715T0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nme8Q715T0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nme8Q715T0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nme8Q715T0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nme8Q715T0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nme8Q715T0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nme8Q715T0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nme8Q715T0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nme8Q715T0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nme8Q715T0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Nme8Q715T0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nme8Q715T0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nme8Q715T0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nme8Q715T0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Nme8Q715T0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nme8Q715T0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nme8Q715T0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nme8Q715T0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nme8Q715T0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nme8Q715T0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nme8Q715T0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nme8Q715T0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nme8Q715T0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nme8Q715T0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nme8Q715T0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Nme8Q715T0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nme8Q715T0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nme8Q715T0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Nme8Q715T0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nme8Q715T0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nme8Q715T0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nme8Q715T0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nme8Q715T0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Nme8Q715T0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nme8Q715T0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nme8Q715T0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nme8Q715T0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nme8Q715T0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nme8Q715T0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Nme8Q715T0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nme8Q715T0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nme8Q715T0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nme8Q715T0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nme8Q715T0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nme8Q715T0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Nme8Q715T0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nme8Q715T0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nme8Q715T0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nme8Q715T0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nme8Q715T0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nme8Q715T0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nme8Q715T0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nme8Q715T0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nme8Q715T0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nme8Q715T0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Nme8Q715T0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nme8Q715T0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nme8Q715T0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nme8Q715T0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nme8Q715T0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nme8Q715T0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nme8Q715T0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nme8Q715T0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nme8Q715T0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms