Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpv1Q704Y3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpv1Q704Y3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpv1Q704Y3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpv1Q704Y3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpv1Q704Y3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpv1Q704Y3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpv1Q704Y3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpv1Q704Y3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpv1Q704Y3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpv1Q704Y3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpv1Q704Y3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpv1Q704Y3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpv1Q704Y3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpv1Q704Y3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpv1Q704Y3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpv1Q704Y3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpv1Q704Y3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpv1Q704Y3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpv1Q704Y3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpv1Q704Y3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpv1Q704Y3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpv1Q704Y3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpv1Q704Y3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpv1Q704Y3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpv1Q704Y3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpv1Q704Y3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpv1Q704Y3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpv1Q704Y3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpv1Q704Y3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpv1Q704Y3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpv1Q704Y3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpv1Q704Y3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpv1Q704Y3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpv1Q704Y3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpv1Q704Y3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpv1Q704Y3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpv1Q704Y3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpv1Q704Y3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpv1Q704Y3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpv1Q704Y3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpv1Q704Y3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpv1Q704Y3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpv1Q704Y3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpv1Q704Y3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpv1Q704Y3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpv1Q704Y3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpv1Q704Y3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpv1Q704Y3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpv1Q704Y3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpv1Q704Y3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpv1Q704Y3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpv1Q704Y3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpv1Q704Y3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpv1Q704Y3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpv1Q704Y3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpv1Q704Y3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpv1Q704Y3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpv1Q704Y3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpv1Q704Y3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpv1Q704Y3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpv1Q704Y3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpv1Q704Y3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpv1Q704Y3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpv1Q704Y3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trpv1Q704Y3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Trpv1Q704Y3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpv1Q704Y3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpv1Q704Y3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpv1Q704Y3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpv1Q704Y3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpv1Q704Y3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpv1Q704Y3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpv1Q704Y3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpv1Q704Y3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpv1Q704Y3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpv1Q704Y3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpv1Q704Y3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpv1Q704Y3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpv1Q704Y3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpv1Q704Y3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpv1Q704Y3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpv1Q704Y3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpv1Q704Y3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpv1Q704Y3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpv1Q704Y3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpv1Q704Y3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpv1Q704Y3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpv1Q704Y3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpv1Q704Y3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpv1Q704Y3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpv1Q704Y3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpv1Q704Y3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpv1Q704Y3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpv1Q704Y3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpv1Q704Y3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpv1Q704Y3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpv1Q704Y3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpv1Q704Y3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpv1Q704Y3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms