Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR4

Ppp2r2b, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp2r2bQ6ZWR4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppp2r2bQ6ZWR4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppp2r2bQ6ZWR4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppp2r2bQ6ZWR4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppp2r2bQ6ZWR4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppp2r2bQ6ZWR4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppp2r2bQ6ZWR4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppp2r2bQ6ZWR4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppp2r2bQ6ZWR4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppp2r2bQ6ZWR4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppp2r2bQ6ZWR4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppp2r2bQ6ZWR4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppp2r2bQ6ZWR4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppp2r2bQ6ZWR4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppp2r2bQ6ZWR4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppp2r2bQ6ZWR4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppp2r2bQ6ZWR4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppp2r2bQ6ZWR4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppp2r2bQ6ZWR4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppp2r2bQ6ZWR4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ppp2r2bQ6ZWR4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ppp2r2bQ6ZWR4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ppp2r2bQ6ZWR4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ppp2r2bQ6ZWR4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ppp2r2bQ6ZWR4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ppp2r2bQ6ZWR4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppp2r2bQ6ZWR4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppp2r2bQ6ZWR4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppp2r2bQ6ZWR4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppp2r2bQ6ZWR4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppp2r2bQ6ZWR4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppp2r2bQ6ZWR4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppp2r2bQ6ZWR4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppp2r2bQ6ZWR4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppp2r2bQ6ZWR4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppp2r2bQ6ZWR4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppp2r2bQ6ZWR4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppp2r2bQ6ZWR4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppp2r2bQ6ZWR4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppp2r2bQ6ZWR4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppp2r2bQ6ZWR4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppp2r2bQ6ZWR4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppp2r2bQ6ZWR4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppp2r2bQ6ZWR4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppp2r2bQ6ZWR4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppp2r2bQ6ZWR4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppp2r2bQ6ZWR4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppp2r2bQ6ZWR4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppp2r2bQ6ZWR4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppp2r2bQ6ZWR4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ppp2r2bQ6ZWR4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ppp2r2bQ6ZWR4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ppp2r2bQ6ZWR4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ppp2r2bQ6ZWR4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms