Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nup188Q6ZQH8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nup188Q6ZQH8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nup188Q6ZQH8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nup188Q6ZQH8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nup188Q6ZQH8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Nup188Q6ZQH8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nup188Q6ZQH8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nup188Q6ZQH8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nup188Q6ZQH8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nup188Q6ZQH8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nup188Q6ZQH8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nup188Q6ZQH8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nup188Q6ZQH8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Nup188Q6ZQH8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nup188Q6ZQH8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup188Q6ZQH8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup188Q6ZQH8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup188Q6ZQH8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup188Q6ZQH8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup188Q6ZQH8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup188Q6ZQH8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup188Q6ZQH8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup188Q6ZQH8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup188Q6ZQH8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup188Q6ZQH8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup188Q6ZQH8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup188Q6ZQH8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Nup188Q6ZQH8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nup188Q6ZQH8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nup188Q6ZQH8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nup188Q6ZQH8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nup188Q6ZQH8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nup188Q6ZQH8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nup188Q6ZQH8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nup188Q6ZQH8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nup188Q6ZQH8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nup188Q6ZQH8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Nup188Q6ZQH8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nup188Q6ZQH8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nup188Q6ZQH8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nup188Q6ZQH8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nup188Q6ZQH8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nup188Q6ZQH8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nup188Q6ZQH8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nup188Q6ZQH8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nup188Q6ZQH8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nup188Q6ZQH8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Nup188Q6ZQH8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nup188Q6ZQH8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nup188Q6ZQH8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nup188Q6ZQH8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nup188Q6ZQH8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nup188Q6ZQH8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nup188Q6ZQH8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nup188Q6ZQH8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nup188Q6ZQH8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nup188Q6ZQH8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nup188Q6ZQH8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nup188Q6ZQH8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nup188Q6ZQH8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Nup188Q6ZQH8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Nup188Q6ZQH8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nup188Q6ZQH8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nup188Q6ZQH8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nup188Q6ZQH8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nup188Q6ZQH8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nup188Q6ZQH8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nup188Q6ZQH8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Nup188Q6ZQH8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nup188Q6ZQH8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nup188Q6ZQH8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nup188Q6ZQH8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nup188Q6ZQH8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nup188Q6ZQH8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nup188Q6ZQH8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nup188Q6ZQH8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nup188Q6ZQH8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nup188Q6ZQH8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nup188Q6ZQH8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nup188Q6ZQH8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Nup188Q6ZQH8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nup188Q6ZQH8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nup188Q6ZQH8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nup188Q6ZQH8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nup188Q6ZQH8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nup188Q6ZQH8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nup188Q6ZQH8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nup188Q6ZQH8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nup188Q6ZQH8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nup188Q6ZQH8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nup188Q6ZQH8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Nup188Q6ZQH8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup188Q6ZQH8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup188Q6ZQH8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup188Q6ZQH8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup188Q6ZQH8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup188Q6ZQH8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup188Q6ZQH8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup188Q6ZQH8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms