Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp34Q6ZQ93 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp34Q6ZQ93 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp34Q6ZQ93 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp34Q6ZQ93 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp34Q6ZQ93 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp34Q6ZQ93 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp34Q6ZQ93 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp34Q6ZQ93 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp34Q6ZQ93 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp34Q6ZQ93 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp34Q6ZQ93 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp34Q6ZQ93 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp34Q6ZQ93 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp34Q6ZQ93 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp34Q6ZQ93 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp34Q6ZQ93 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp34Q6ZQ93 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp34Q6ZQ93 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp34Q6ZQ93 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp34Q6ZQ93 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp34Q6ZQ93 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp34Q6ZQ93 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp34Q6ZQ93 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp34Q6ZQ93 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp34Q6ZQ93 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp34Q6ZQ93 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp34Q6ZQ93 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
Usp34Q6ZQ93 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp34Q6ZQ93 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp34Q6ZQ93 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp34Q6ZQ93 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp34Q6ZQ93 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp34Q6ZQ93 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp34Q6ZQ93 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp34Q6ZQ93 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp34Q6ZQ93 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp34Q6ZQ93 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp34Q6ZQ93 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp34Q6ZQ93 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp34Q6ZQ93 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp34Q6ZQ93 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp34Q6ZQ93 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp34Q6ZQ93 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp34Q6ZQ93 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp34Q6ZQ93 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp34Q6ZQ93 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp34Q6ZQ93 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp34Q6ZQ93 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp34Q6ZQ93 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp34Q6ZQ93 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp34Q6ZQ93 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp34Q6ZQ93 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp34Q6ZQ93 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp34Q6ZQ93 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp34Q6ZQ93 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp34Q6ZQ93 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp34Q6ZQ93 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp34Q6ZQ93 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp34Q6ZQ93 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp34Q6ZQ93 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Usp34Q6ZQ93 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Usp34Q6ZQ93 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp34Q6ZQ93 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp34Q6ZQ93 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp34Q6ZQ93 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp34Q6ZQ93 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp34Q6ZQ93 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp34Q6ZQ93 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp34Q6ZQ93 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp34Q6ZQ93 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp34Q6ZQ93 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp34Q6ZQ93 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp34Q6ZQ93 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp34Q6ZQ93 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp34Q6ZQ93 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp34Q6ZQ93 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp34Q6ZQ93 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp34Q6ZQ93 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp34Q6ZQ93 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp34Q6ZQ93 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp34Q6ZQ93 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp34Q6ZQ93 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp34Q6ZQ93 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp34Q6ZQ93 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp34Q6ZQ93 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp34Q6ZQ93 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp34Q6ZQ93 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp34Q6ZQ93 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp34Q6ZQ93 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp34Q6ZQ93 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp34Q6ZQ93 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp34Q6ZQ93 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp34Q6ZQ93 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp34Q6ZQ93 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp34Q6ZQ93 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp34Q6ZQ93 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp34Q6ZQ93 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp34Q6ZQ93 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp34Q6ZQ93 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms