Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR4

Kcnt1, Potassium channel subfamily T member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnt1Q6ZPR4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnt1Q6ZPR4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnt1Q6ZPR4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnt1Q6ZPR4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnt1Q6ZPR4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcnt1Q6ZPR4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcnt1Q6ZPR4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcnt1Q6ZPR4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcnt1Q6ZPR4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcnt1Q6ZPR4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnt1Q6ZPR4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnt1Q6ZPR4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnt1Q6ZPR4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnt1Q6ZPR4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnt1Q6ZPR4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnt1Q6ZPR4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnt1Q6ZPR4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnt1Q6ZPR4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnt1Q6ZPR4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnt1Q6ZPR4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnt1Q6ZPR4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnt1Q6ZPR4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnt1Q6ZPR4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kcnt1Q6ZPR4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnt1Q6ZPR4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnt1Q6ZPR4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnt1Q6ZPR4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnt1Q6ZPR4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnt1Q6ZPR4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnt1Q6ZPR4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnt1Q6ZPR4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnt1Q6ZPR4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnt1Q6ZPR4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnt1Q6ZPR4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnt1Q6ZPR4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnt1Q6ZPR4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnt1Q6ZPR4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnt1Q6ZPR4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnt1Q6ZPR4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnt1Q6ZPR4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnt1Q6ZPR4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnt1Q6ZPR4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnt1Q6ZPR4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnt1Q6ZPR4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnt1Q6ZPR4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnt1Q6ZPR4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnt1Q6ZPR4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnt1Q6ZPR4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnt1Q6ZPR4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnt1Q6ZPR4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnt1Q6ZPR4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnt1Q6ZPR4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnt1Q6ZPR4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnt1Q6ZPR4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnt1Q6ZPR4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnt1Q6ZPR4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcnt1Q6ZPR4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcnt1Q6ZPR4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcnt1Q6ZPR4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcnt1Q6ZPR4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcnt1Q6ZPR4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnt1Q6ZPR4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnt1Q6ZPR4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnt1Q6ZPR4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnt1Q6ZPR4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnt1Q6ZPR4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnt1Q6ZPR4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnt1Q6ZPR4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcnt1Q6ZPR4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcnt1Q6ZPR4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcnt1Q6ZPR4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcnt1Q6ZPR4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcnt1Q6ZPR4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcnt1Q6ZPR4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcnt1Q6ZPR4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kcnt1Q6ZPR4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kcnt1Q6ZPR4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnt1Q6ZPR4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnt1Q6ZPR4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnt1Q6ZPR4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnt1Q6ZPR4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnt1Q6ZPR4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnt1Q6ZPR4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnt1Q6ZPR4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnt1Q6ZPR4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnt1Q6ZPR4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnt1Q6ZPR4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnt1Q6ZPR4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnt1Q6ZPR4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnt1Q6ZPR4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnt1Q6ZPR4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnt1Q6ZPR4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnt1Q6ZPR4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnt1Q6ZPR4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnt1Q6ZPR4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnt1Q6ZPR4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnt1Q6ZPR4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnt1Q6ZPR4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnt1Q6ZPR4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnt1Q6ZPR4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms